Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACAA1P09110 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACAA1P09110 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACAA1P09110 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACAA1P09110 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAA1P09110 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA1P09110 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAA1P09110 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAA1P09110 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA1P09110 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACAA1P09110 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAA1P09110 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms