Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC3BP05452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLEC3BP05452 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLEC3BP05452 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLEC3BP05452 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC3BP05452 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC3BP05452 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC3BP05452 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC3BP05452 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC3BP05452 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC3BP05452 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC3BP05452 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC3BP05452 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC3BP05452 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC3BP05452 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC3BP05452 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC3BP05452 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC3BP05452 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC3BP05452 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLEC3BP05452 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC3BP05452 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC3BP05452 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC3BP05452 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC3BP05452 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms