Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLOD3O60568 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLOD3O60568 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLOD3O60568 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLOD3O60568 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLOD3O60568 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLOD3O60568 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLOD3O60568 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLOD3O60568 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLOD3O60568 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLOD3O60568 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD3O60568 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLOD3O60568 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD3O60568 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLOD3O60568 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLOD3O60568 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLOD3O60568 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLOD3O60568 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD3O60568 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLOD3O60568 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms