Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCO2O43819 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCO2O43819 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCO2O43819 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCO2O43819 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCO2O43819 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCO2O43819 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCO2O43819 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCO2O43819 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCO2O43819 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCO2O43819 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SCO2O43819 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCO2O43819 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCO2O43819 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCO2O43819 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCO2O43819 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCO2O43819 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCO2O43819 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCO2O43819 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCO2O43819 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCO2O43819 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCO2O43819 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCO2O43819 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCO2O43819 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCO2O43819 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCO2O43819 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCO2O43819 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCO2O43819 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCO2O43819 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCO2O43819 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCO2O43819 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCO2O43819 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCO2O43819 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCO2O43819 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCO2O43819 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCO2O43819 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCO2O43819 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCO2O43819 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCO2O43819 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCO2O43819 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCO2O43819 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCO2O43819 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCO2O43819 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCO2O43819 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCO2O43819 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCO2O43819 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCO2O43819 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCO2O43819 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCO2O43819 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCO2O43819 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCO2O43819 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCO2O43819 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCO2O43819 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCO2O43819 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCO2O43819 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCO2O43819 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCO2O43819 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCO2O43819 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCO2O43819 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCO2O43819 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCO2O43819 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCO2O43819 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCO2O43819 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCO2O43819 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCO2O43819 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCO2O43819 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCO2O43819 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCO2O43819 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCO2O43819 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCO2O43819 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCO2O43819 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCO2O43819 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCO2O43819 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCO2O43819 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCO2O43819 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCO2O43819 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCO2O43819 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCO2O43819 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCO2O43819 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCO2O43819 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCO2O43819 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCO2O43819 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCO2O43819 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCO2O43819 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCO2O43819 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCO2O43819 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCO2O43819 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCO2O43819 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCO2O43819 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCO2O43819 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCO2O43819 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SCO2O43819 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCO2O43819 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCO2O43819 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCO2O43819 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCO2O43819 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCO2O43819 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCO2O43819 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCO2O43819 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCO2O43819 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms