Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3QR06 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3QR06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QR06 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QR06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3QR06 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QR06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QR06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3QR06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3QR06 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QR06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3QR06 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QR06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3QR06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QR06 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QR06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3QR06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QR06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QR06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3QR06 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QR06 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QR06 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QR06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QR06 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QR06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QR06 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QR06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QR06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QR06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QR06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QR06 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QR06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QR06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QR06 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QR06 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QR06 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QR06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QR06 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QR06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QR06 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QR06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QR06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QR06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QR06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QR06 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QR06 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QR06 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QR06 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QR06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QR06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QR06 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QR06 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QR06 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QR06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QR06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QR06 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QR06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QR06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QR06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QR06 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QR06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QR06 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QR06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QR06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QR06 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QR06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QR06 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QR06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QR06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QR06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QR06 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QR06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QR06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QR06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QR06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QR06 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QR06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QR06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QR06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QR06 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QR06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QR06 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QR06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QR06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QR06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QR06 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QR06 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QR06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3QR06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QR06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QR06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QR06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QR06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QR06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QR06 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QR06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QR06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QR06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QR06 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QR06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms