Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RASA4BC9J798 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASA4BC9J798 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASA4BC9J798 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASA4BC9J798 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASA4BC9J798 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RASA4BC9J798 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASA4BC9J798 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASA4BC9J798 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASA4BC9J798 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASA4BC9J798 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RASA4BC9J798 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RASA4BC9J798 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RASA4BC9J798 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASA4BC9J798 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASA4BC9J798 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASA4BC9J798 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASA4BC9J798 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASA4BC9J798 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RASA4BC9J798 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RASA4BC9J798 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA4BC9J798 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RASA4BC9J798 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA4BC9J798 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA4BC9J798 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA4BC9J798 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASA4BC9J798 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASA4BC9J798 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA4BC9J798 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASA4BC9J798 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASA4BC9J798 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASA4BC9J798 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RASA4BC9J798 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASA4BC9J798 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASA4BC9J798 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms