Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC8

Putative TAF11-like protein ENSP00000332601, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NLC8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NLC8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NLC8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NLC8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NLC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NLC8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NLC8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NLC8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NLC8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NLC8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NLC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NLC8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NLC8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NLC8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NLC8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NLC8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NLC8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NLC8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NLC8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NLC8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NLC8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NLC8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NLC8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NLC8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NLC8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NLC8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NLC8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NLC8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NLC8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NLC8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NLC8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NLC8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NLC8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NLC8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NLC8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NLC8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NLC8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A6NLC8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NLC8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NLC8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NLC8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NLC8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NLC8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NLC8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NLC8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NLC8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NLC8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NLC8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NLC8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NLC8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NLC8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NLC8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NLC8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NLC8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NLC8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NLC8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NLC8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NLC8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NLC8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NLC8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NLC8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NLC8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NLC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NLC8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NLC8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NLC8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NLC8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NLC8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NLC8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NLC8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NLC8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NLC8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NLC8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NLC8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NLC8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NLC8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NLC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NLC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NLC8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NLC8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NLC8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NLC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NLC8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NLC8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NLC8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NLC8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NLC8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NLC8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NLC8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NLC8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NLC8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NLC8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NLC8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NLC8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NLC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NLC8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NLC8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NLC8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NLC8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NLC8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms