Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf92A6NGG3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf92A6NGG3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf92A6NGG3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf92A6NGG3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf92A6NGG3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf92A6NGG3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms