Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
VWA3AA6NCI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
VWA3AA6NCI4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
VWA3AA6NCI4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
VWA3AA6NCI4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
VWA3AA6NCI4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VWA3AA6NCI4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VWA3AA6NCI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
VWA3AA6NCI4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
VWA3AA6NCI4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VWA3AA6NCI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
VWA3AA6NCI4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VWA3AA6NCI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VWA3AA6NCI4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
VWA3AA6NCI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
VWA3AA6NCI4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VWA3AA6NCI4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
VWA3AA6NCI4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VWA3AA6NCI4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms