Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG9

ARPC4-TTLL3, Protein ARPC4-TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms