Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG9

ARPC4-TTLL3, Protein ARPC4-TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms