Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms