Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.365e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.835e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.365e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 56.3□□□□□ -1.45e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 54.63□□□□□ -1.675e-16■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 511.53□□□□□ -0.561e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.87□□□□□ -0.991e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 38.24□□□□□ -1.091e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.21e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.271e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 MAP7D1-202ENST00000373148 1797 ntTSL 225.85■■□□□ 1.732e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 MAP1LC3B-205ENST00000564638 735 ntTSL 27.29□□□□□ -1.248e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.916e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 520.37■□□□□ 0.856e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.416e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 517.04■□□□□ 0.326e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.236e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ODF2-207ENST00000421776 1254 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ODF2-219ENST00000546203 2140 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 SMARCC2-214ENST00000552674 3730 ntTSL 28.93□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-215ENST00000550201 1527 ntTSL 512.42□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-212ENST00000549394 1439 ntTSL 211.78□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-201ENST00000434715 1677 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-218ENST00000550954 892 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-209ENST00000548249 2061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.93e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-224ENST00000552390 842 ntTSL 58.52□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-206ENST00000546965 542 ntTSL 47.81□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-214ENST00000550086 384 ntTSL 57.43□□□□□ -1.223e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-222ENST00000551611 502 ntTSL 57.3□□□□□ -1.243e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 DCTN2-204ENST00000546670 580 ntTSL 36.04□□□□□ -1.443e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.918e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.478e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.558e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.942e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 517.92■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 KRT18-203ENST00000546656 521 ntTSL 214.85□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 59.33□□□□□ -0.924e-8■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 NAP1L1-223ENST00000552013 679 ntTSL 28.02□□□□□ -1.132e-15■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 49.67□□□□□ -0.861e-11■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CASC3-203ENST00000418132 1986 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CASC3-204ENST00000474190 908 ntTSL 310.23□□□□□ -0.773e-7■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.963e-6■■■□□ 15.5
PUM1Q14671 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.961e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.91e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)26.93■■□□□ 1.91e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.881e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.441e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.051e-23■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.465e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.15e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.175e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.38□□□□□ -0.278e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.298e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.594e-11■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 217.54■□□□□ 0.45e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 212.86□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 DNMT1-204ENST00000585843 911 ntTSL 314.08□□□□□ -0.164e-7■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-17■■■□□ 15.4
PUM1Q14671 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.51e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.391e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 421.52■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 11e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 220.51■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-214ENST00000591293 645 ntTSL 320.5■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-220ENST00000483165 603 ntTSL 419.42■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 318.29■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 15.3
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