Protein–RNA interactions for Protein: Q92900

UPF1, Regulator of nonsense transcripts 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF1Q92900 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 523.46■■□□□ 1.356e-8■■■■■ 34.7
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UPF1Q92900 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 520.01■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 34.7
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UPF1Q92900 P3H4-205ENST00000484247 1866 ntTSL 217.88■□□□□ 0.459e-8■■■■■ 34.7
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UPF1Q92900 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 34.7
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UPF1Q92900 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 34.7
UPF1Q92900 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)22.75■■□□□ 1.233e-11■■■■■ 34.6
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UPF1Q92900 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 34.5
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UPF1Q92900 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 34.5
UPF1Q92900 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 34.5
UPF1Q92900 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 34.5
UPF1Q92900 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.751e-18■■■■■ 34.5
UPF1Q92900 GNPNAT1-204ENST00000554421 416 ntTSL 311.82□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 34.4
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UPF1Q92900 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.057e-9■■■■■ 34.4
UPF1Q92900 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 34.4
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UPF1Q92900 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.658e-11■■■■■ 34.4
UPF1Q92900 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.737e-11■■■■■ 34.4
UPF1Q92900 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.747e-11■■■■■ 34.4
UPF1Q92900 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 34.4
UPF1Q92900 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.119e-9■■■■■ 34.4
UPF1Q92900 MLEC-203ENST00000535413 617 ntTSL 215.29■□□□□ 0.049e-12■■■■■ 34.3
UPF1Q92900 LMAN2L-203ENST00000434524 2410 ntTSL 515.79■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34.3
UPF1Q92900 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 34.3
UPF1Q92900 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 34.3
UPF1Q92900 TMEM97-202ENST00000336687 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 34.3
UPF1Q92900 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.325e-22■■■■■ 34.3
UPF1Q92900 NUDCD3-206ENST00000475952 983 ntTSL 217.08■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 POR-222ENST00000493973 1028 ntTSL 225.75■■□□□ 1.712e-12■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.922e-12■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 POR-216ENST00000454934 2295 ntTSL 318.58■□□□□ 0.562e-12■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-12■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 SLC44A2-204ENST00000586549 1300 ntTSL 525.99■■□□□ 1.751e-8■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 PTPRF-204ENST00000412568 4154 ntTSL 511.62□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.543e-14■■■■■ 34.2
UPF1Q92900 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-14■■■■■ 34.2
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