RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565397.1

KIFC3-221, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 3

Gene KIFC3, Length 810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-221ENST00000565397 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.23■■■■■ 5.15
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KIFC3-221ENST00000565397 SCRIBQ14160 1630 aa38.63■■■■□ 3.78
KIFC3-221ENST00000565397 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.56■■■■□ 3.76
KIFC3-221ENST00000565397 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.51■■■■□ 3.76
KIFC3-221ENST00000565397 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
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KIFC3-221ENST00000565397 ERCC6Q03468 1493 aa36.9■■■■□ 3.5
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KIFC3-221ENST00000565397 SMARCA4P51532 1647 aa36.87■■■■□ 3.49
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KIFC3-221ENST00000565397 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.56■■■■□ 3.44
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KIFC3-221ENST00000565397 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.09■■■■□ 3.37
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KIFC3-221ENST00000565397 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.85■■■■□ 3.33
KIFC3-221ENST00000565397 WDR62O43379 1518 aa35.76■■■■□ 3.31
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KIFC3-221ENST00000565397 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.06■■■■□ 3.2
KIFC3-221ENST00000565397 IFT140Q96RY7 1462 aa34.97■■■■□ 3.19
KIFC3-221ENST00000565397 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
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KIFC3-221ENST00000565397 ABCC8Q09428 1581 aa34.86■■■■□ 3.17
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KIFC3-221ENST00000565397 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.73■■■■□ 3.15
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KIFC3-221ENST00000565397 CHD1O14646 1710 aa34.44■■■■□ 3.1
KIFC3-221ENST00000565397 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.4■■■■□ 3.1
KIFC3-221ENST00000565397 FBLN2P98095 1184 aa34.39■■■■□ 3.1
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KIFC3-221ENST00000565397 ARAP1Q96P48 1450 aa34.26■■■■□ 3.07
KIFC3-221ENST00000565397 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.25■■■■□ 3.07
KIFC3-221ENST00000565397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.19■■■■□ 3.06
KIFC3-221ENST00000565397 CUX1P39880 1505 aa34.17■■■■□ 3.06
KIFC3-221ENST00000565397 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
KIFC3-221ENST00000565397 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
KIFC3-221ENST00000565397 GRIN2BQ13224 1484 aa34.11■■■■□ 3.05
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KIFC3-221ENST00000565397 SYNJ2O15056 1496 aa34.02■■■■□ 3.04
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KIFC3-221ENST00000565397 CEP170Q5SW79 1584 aa33.51■■■□□ 2.95
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KIFC3-221ENST00000565397 SHROOM2Q13796 1616 aa33.42■■■□□ 2.94
KIFC3-221ENST00000565397 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
KIFC3-221ENST00000565397 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
KIFC3-221ENST00000565397 JPH4Q96JJ6 628 aa33.24■■■□□ 2.91
KIFC3-221ENST00000565397 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.1■■■□□ 2.89
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