RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452133.1

SYS1-DBNDD2-202, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene SYS1-DBNDD2, Length 674 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.71■■■□□ 2.35
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.82■■□□□ 1.72
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 NACADO15069 1562 aa25.5■■□□□ 1.67
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.32■■□□□ 1.64
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SCRIBQ14160 1630 aa24.52■■□□□ 1.52
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ERCC6Q03468 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 NCAPD3P42695 1498 aa23.54■■□□□ 1.36
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 NESP48681 1621 aa23.4■■□□□ 1.34
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 HMGXB3Q12766 1538 aa23.33■■□□□ 1.33
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SMARCA4P51532 1647 aa23.31■■□□□ 1.32
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.11■■□□□ 1.29
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.04■■□□□ 1.28
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.99■■□□□ 1.27
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.92■■□□□ 1.26
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.81■■□□□ 1.24
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 WDR62O43379 1518 aa22.78■■□□□ 1.24
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 WIZO95785 1651 aa22.65■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.65■■□□□ 1.22
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 OSCARQ8IYS5 282 aa22.59■■□□□ 1.21
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.59■■□□□ 1.21
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CFTRP13569 1480 aa22.45■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.4■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.4■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.4■■□□□ 1.18
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 PRDM2Q13029 1718 aa22.26■■□□□ 1.15
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ARHGEF11O15085 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 IFT140Q96RY7 1462 aa22.2■■□□□ 1.14
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.13■■□□□ 1.13
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 TOPBP1Q92547 1522 aa22.11■■□□□ 1.13
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CHD1O14646 1710 aa22.08■■□□□ 1.12
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.05■■□□□ 1.12
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ARAP1Q96P48 1450 aa22.01■■□□□ 1.11
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 FBLN2P98095 1184 aa21.97■■□□□ 1.11
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SOGA1O94964 1423 aa21.74■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.74■■□□□ 1.07
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SYNJ1O43426 1573 aa21.7■■□□□ 1.06
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.65■■□□□ 1.06
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 WDR97A6NE52 1622 aa21.64■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 GRIN2BQ13224 1484 aa21.59■■□□□ 1.05
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SYNJ2O15056 1496 aa21.58■■□□□ 1.04
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CUX1P39880 1505 aa21.56■■□□□ 1.04
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 PBRM1Q86U86 1689 aa21.53■■□□□ 1.04
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.39■■□□□ 1.01
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SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 GRIN2AQ12879 1464 aa21.32■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 CEP170Q5SW79 1584 aa21.31■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.27■■□□□ 1
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ADAMTS12P58397 1594 aa21.27■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 NUP160Q12769 1436 aa21.25■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 SHROOM2Q13796 1616 aa21.24■□□□□ 0.99
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.15■□□□□ 0.98
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.09■□□□□ 0.97
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 TOP2BQ02880 1626 aa21.07■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.07■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.07■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 JPH4Q96JJ6 628 aa21.05■□□□□ 0.96
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