RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419593.5

SYS1-DBNDD2-201, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SYS1-DBNDD2, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.4■■■■■ 4.22
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ABCC9O60706 1549 aa37.47■■■■□ 3.59
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.18■■■■□ 3.54
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.53■■■■□ 3.28
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.41■■■■□ 3.26
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NACADO15069 1562 aa35.25■■■■□ 3.23
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.13■■■■□ 3.21
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.18
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.71■■■■□ 3.15
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.68■■■■□ 3.14
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.52■■■■□ 3.12
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.16■■■■□ 3.06
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34■■■■□ 3.03
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SCRIBQ14160 1630 aa33.9■■■■□ 3.02
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.82■■■■□ 3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.77■■■■□ 3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.67■■■□□ 2.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NCAPD3P42695 1498 aa32.57■■■□□ 2.8
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.44■■■□□ 2.78
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CUX2O14529 1486 aa32.36■■■□□ 2.77
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ERCC6Q03468 1493 aa32.36■■■□□ 2.77
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SMARCA4P51532 1647 aa32.31■■■□□ 2.76
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SMARCA2P51531 1590 aa32.31■■■□□ 2.76
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HMGXB3Q12766 1538 aa32.26■■■□□ 2.76
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NESP48681 1621 aa32.13■■■□□ 2.73
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PEG3Q9GZU2 1588 aa32■■■□□ 2.71
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.91■■■□□ 2.7
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.84■■■□□ 2.69
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.7■■■□□ 2.67
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.66■■■□□ 2.66
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.59■■■□□ 2.65
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WIZO95785 1651 aa31.5■■■□□ 2.63
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.42■■■□□ 2.62
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WDR62O43379 1518 aa31.33■■■□□ 2.61
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.25■■■□□ 2.59
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.21■■■□□ 2.59
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CFTRP13569 1480 aa31.17■■■□□ 2.58
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TRIM41Q8WV44 630 aa31.14■■■□□ 2.58
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 OSCARQ8IYS5 282 aa30.93■■■□□ 2.54
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.77■■■□□ 2.52
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PRDM2Q13029 1718 aa30.75■■■□□ 2.51
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 IFT140Q96RY7 1462 aa30.64■■■□□ 2.5
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TOPBP1Q92547 1522 aa30.59■■■□□ 2.49
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ABCC8Q09428 1581 aa30.5■■■□□ 2.47
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.46■■■□□ 2.47
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.46■■■□□ 2.47
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.46■■■□□ 2.47
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.43■■■□□ 2.46
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ARHGEF11O15085 1522 aa30.35■■■□□ 2.45
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.458e-8■■■■■ 39.5
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.22■■■□□ 2.43
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FBLN2P98095 1184 aa30.22■■■□□ 2.43
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CHD1O14646 1710 aa30.21■■■□□ 2.43
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.18■■■□□ 2.42
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SOGA1O94964 1423 aa30.15■■■□□ 2.42
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ARAP1Q96P48 1450 aa30.05■■■□□ 2.4
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.04■■■□□ 2.4
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.99■■■□□ 2.39
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CUX1P39880 1505 aa29.98■■■□□ 2.39
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WDR97A6NE52 1622 aa29.97■■■□□ 2.39
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GRIN2BQ13224 1484 aa29.89■■■□□ 2.37
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.87■■■□□ 2.37
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SYNJ1O43426 1573 aa29.83■■■□□ 2.37
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SYNJ2O15056 1496 aa29.81■■■□□ 2.36
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.77■■■□□ 2.36
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PBRM1Q86U86 1689 aa29.7■■■□□ 2.35
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.69■■■□□ 2.34
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.63■■■□□ 2.33
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GRIN2AQ12879 1464 aa29.5■■■□□ 2.31
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TOP2BQ02880 1626 aa29.42■■■□□ 2.3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.42■■■□□ 2.3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.42■■■□□ 2.3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ADAMTS12P58397 1594 aa29.41■■■□□ 2.3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NUP160Q12769 1436 aa29.41■■■□□ 2.3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CEP170Q5SW79 1584 aa29.39■■■□□ 2.3
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.38■■■□□ 2.29
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.3■■■□□ 2.28
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SHROOM2Q13796 1616 aa29.27■■■□□ 2.28
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 JPH4Q96JJ6 628 aa29.18■■■□□ 2.26
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29■■■□□ 2.23
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