RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488711.1

EHD1-210, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-210ENST00000488711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.3■■■■■ 5.64
EHD1-210ENST00000488711 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.91■■■■■ 4.78
EHD1-210ENST00000488711 ABCC9O60706 1549 aa44.59■■■■■ 4.73
EHD1-210ENST00000488711 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.55■■■■■ 4.4
EHD1-210ENST00000488711 NACADO15069 1562 aa42.35■■■■■ 4.37
EHD1-210ENST00000488711 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.34■■■■■ 4.37
EHD1-210ENST00000488711 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.86■■■■■ 4.29
EHD1-210ENST00000488711 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
EHD1-210ENST00000488711 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.64■■■■■ 4.26
EHD1-210ENST00000488711 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
EHD1-210ENST00000488711 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.51■■■■■ 4.24
EHD1-210ENST00000488711 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.45■■■■■ 4.23
EHD1-210ENST00000488711 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.35■■■■■ 4.21
EHD1-210ENST00000488711 SCRIBQ14160 1630 aa41.04■■■■■ 4.16
EHD1-210ENST00000488711 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.71■■■■■ 4.11
EHD1-210ENST00000488711 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
EHD1-210ENST00000488711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.27■■■■■ 4.04
EHD1-210ENST00000488711 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.08■■■■■ 4.01
EHD1-210ENST00000488711 SMARCA4P51532 1647 aa39.16■■■■□ 3.86
EHD1-210ENST00000488711 NCAPD3P42695 1498 aa39.11■■■■□ 3.85
EHD1-210ENST00000488711 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.08■■■■□ 3.85
EHD1-210ENST00000488711 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
EHD1-210ENST00000488711 SMARCA2P51531 1590 aa38.96■■■■□ 3.83
EHD1-210ENST00000488711 HMGXB3Q12766 1538 aa38.85■■■■□ 3.81
EHD1-210ENST00000488711 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.81■■■■□ 3.8
EHD1-210ENST00000488711 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.73■■■■□ 3.79
EHD1-210ENST00000488711 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
EHD1-210ENST00000488711 NESP48681 1621 aa38.45■■■■□ 3.75
EHD1-210ENST00000488711 ERCC6Q03468 1493 aa38.42■■■■□ 3.74
EHD1-210ENST00000488711 WIZO95785 1651 aa38.37■■■■□ 3.73
EHD1-210ENST00000488711 CUX2O14529 1486 aa38.15■■■■□ 3.7
EHD1-210ENST00000488711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.15■■■■□ 3.7
EHD1-210ENST00000488711 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
EHD1-210ENST00000488711 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.95■■■■□ 3.67
EHD1-210ENST00000488711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.94■■■■□ 3.66
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EHD1-210ENST00000488711 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.91■■■■□ 3.66
EHD1-210ENST00000488711 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
EHD1-210ENST00000488711 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.67■■■■□ 3.62
EHD1-210ENST00000488711 CFTRP13569 1480 aa37.61■■■■□ 3.61
EHD1-210ENST00000488711 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.59■■■■□ 3.61
EHD1-210ENST00000488711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.54■■■■□ 3.6
EHD1-210ENST00000488711 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.53■■■■□ 3.6
EHD1-210ENST00000488711 WDR62O43379 1518 aa37.48■■■■□ 3.59
EHD1-210ENST00000488711 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.46■■■■□ 3.59
EHD1-210ENST00000488711 PRDM2Q13029 1718 aa37.26■■■■□ 3.56
EHD1-210ENST00000488711 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
EHD1-210ENST00000488711 TOPBP1Q92547 1522 aa36.89■■■■□ 3.5
EHD1-210ENST00000488711 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
EHD1-210ENST00000488711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.78■■■■□ 3.48
EHD1-210ENST00000488711 ABCC8Q09428 1581 aa36.76■■■■□ 3.48
EHD1-210ENST00000488711 IFT140Q96RY7 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
EHD1-210ENST00000488711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
EHD1-210ENST00000488711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
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EHD1-210ENST00000488711 OSCARQ8IYS5 282 aa36.51■■■■□ 3.44
EHD1-210ENST00000488711 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
EHD1-210ENST00000488711 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.43■■■■□ 3.42
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EHD1-210ENST00000488711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
EHD1-210ENST00000488711 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.39■■■■□ 3.42
EHD1-210ENST00000488711 SOGA1O94964 1423 aa36.37■■■■□ 3.41
EHD1-210ENST00000488711 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
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EHD1-210ENST00000488711 CHD1O14646 1710 aa36.17■■■■□ 3.38
EHD1-210ENST00000488711 FBLN2P98095 1184 aa36.11■■■■□ 3.37
EHD1-210ENST00000488711 WDR97A6NE52 1622 aa36.09■■■■□ 3.37
EHD1-210ENST00000488711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.06■■■■□ 3.36
EHD1-210ENST00000488711 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.03■■■■□ 3.36
EHD1-210ENST00000488711 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.03■■■■□ 3.36
EHD1-210ENST00000488711 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.03■■■■□ 3.36
EHD1-210ENST00000488711 GRIN2BQ13224 1484 aa35.99■■■■□ 3.35
EHD1-210ENST00000488711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.35
EHD1-210ENST00000488711 ARHGEF11O15085 1522 aa35.96■■■■□ 3.35
EHD1-210ENST00000488711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.96■■■■□ 3.35
EHD1-210ENST00000488711 SYNJ1O43426 1573 aa35.95■■■■□ 3.35
EHD1-210ENST00000488711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.94■■■■□ 3.34
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EHD1-210ENST00000488711 TOP2BQ02880 1626 aa35.93■■■■□ 3.34
EHD1-210ENST00000488711 PBRM1Q86U86 1689 aa35.91■■■■□ 3.34
EHD1-210ENST00000488711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.89■■■■□ 3.34
EHD1-210ENST00000488711 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
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EHD1-210ENST00000488711 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.73■■■■□ 3.31
EHD1-210ENST00000488711 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.68■■■■□ 3.3
EHD1-210ENST00000488711 ARAP1Q96P48 1450 aa35.65■■■■□ 3.3
EHD1-210ENST00000488711 ADAMTS12P58397 1594 aa35.59■■■■□ 3.29
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EHD1-210ENST00000488711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.5■■■■□ 3.27
EHD1-210ENST00000488711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.49■■■■□ 3.27
EHD1-210ENST00000488711 CEP170Q5SW79 1584 aa35.42■■■■□ 3.26
EHD1-210ENST00000488711 NUP160Q12769 1436 aa35.4■■■■□ 3.26
EHD1-210ENST00000488711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.28■■■■□ 3.24
EHD1-210ENST00000488711 KIF27Q86VH2 1401 aa35.23■■■■□ 3.23
EHD1-210ENST00000488711 SHROOM2Q13796 1616 aa35.19■■■■□ 3.22
EHD1-210ENST00000488711 IGF1RP08069 1367 aa35.18■■■■□ 3.22
EHD1-210ENST00000488711 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
EHD1-210ENST00000488711 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.08■■■■□ 3.21
EHD1-210ENST00000488711 CUL7Q14999 1698 aa35.08■■■■□ 3.21
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