Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLK1P49759 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLK1P49759 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLK1P49759 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLK1P49759 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLK1P49759 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLK1P49759 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLK1P49759 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLK1P49759 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLK1P49759 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLK1P49759 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms