RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377075.2

CNNM4-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM4, Length 4,800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-201ENST00000377075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.47■■■■□ 3.27
CNNM4-201ENST00000377075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.79■■■■□ 3.16
CNNM4-201ENST00000377075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CNNM4-201ENST00000377075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.85■■■■□ 3.01
CNNM4-201ENST00000377075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.12■■■□□ 2.89
CNNM4-201ENST00000377075 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.54■■■□□ 2.8
CNNM4-201ENST00000377075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
CNNM4-201ENST00000377075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CNNM4-201ENST00000377075 APLP2Q06481 763 aa31.91■■■□□ 2.7
CNNM4-201ENST00000377075 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CNNM4-201ENST00000377075 TRIM41Q8WV44 630 aa31.72■■■□□ 2.67
CNNM4-201ENST00000377075 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
CNNM4-201ENST00000377075 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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CNNM4-201ENST00000377075 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CNNM4-201ENST00000377075 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CNNM4-201ENST00000377075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CNNM4-201ENST00000377075 HRCP23327 699 aa31.14■■■□□ 2.58
CNNM4-201ENST00000377075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.06■■■□□ 2.56
CNNM4-201ENST00000377075 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.04■■■□□ 2.56
CNNM4-201ENST00000377075 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
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CNNM4-201ENST00000377075 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CNNM4-201ENST00000377075 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.51■■■□□ 2.47
CNNM4-201ENST00000377075 NEFLP07196 543 aa30.36■■■□□ 2.45
CNNM4-201ENST00000377075 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CNNM4-201ENST00000377075 ITGAEP38570 1179 aa30.25■■■□□ 2.43
CNNM4-201ENST00000377075 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CNNM4-201ENST00000377075 MYT1Q01538 1121 aa30.05■■■□□ 2.4
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CNNM4-201ENST00000377075 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.7■■■□□ 2.34
CNNM4-201ENST00000377075 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CNNM4-201ENST00000377075 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.55■■■□□ 2.32
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CNNM4-201ENST00000377075 ABCC9O60706 1549 aa29.41■■■□□ 2.3
CNNM4-201ENST00000377075 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CNNM4-201ENST00000377075 NEUROD1Q13562 356 aa29.31■■■□□ 2.28
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CNNM4-201ENST00000377075 BCANQ96GW7 911 aa29.23■■■□□ 2.27
CNNM4-201ENST00000377075 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CNNM4-201ENST00000377075 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CNNM4-201ENST00000377075 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.17■■■□□ 2.26
CNNM4-201ENST00000377075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.12■■■□□ 2.25
CNNM4-201ENST00000377075 TRIM52Q96A61 297 aa29.08■■■□□ 2.25
CNNM4-201ENST00000377075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.95■■■□□ 2.22
CNNM4-201ENST00000377075 ANP32CO43423 234 aa28.94■■■□□ 2.22
CNNM4-201ENST00000377075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CNNM4-201ENST00000377075 P3H3Q8IVL6 736 aa28.83■■■□□ 2.21
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CNNM4-201ENST00000377075 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CNNM4-201ENST00000377075 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CNNM4-201ENST00000377075 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.72■■■□□ 2.19
CNNM4-201ENST00000377075 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.72■■■□□ 2.19
CNNM4-201ENST00000377075 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CNNM4-201ENST00000377075 ARID3CA6NKF2 412 aa28.6■■■□□ 2.17
CNNM4-201ENST00000377075 SCRIBQ14160 1630 aa28.59■■■□□ 2.17
CNNM4-201ENST00000377075 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CNNM4-201ENST00000377075 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CNNM4-201ENST00000377075 FKBP8Q14318 412 aa28.46■■■□□ 2.15
CNNM4-201ENST00000377075 FBLN2P98095 1184 aa28.44■■■□□ 2.14
CNNM4-201ENST00000377075 MIER1Q8N108 512 aa28.4■■■□□ 2.14
CNNM4-201ENST00000377075 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
CNNM4-201ENST00000377075 TONSLQ96HA7 1378 aa28.28■■■□□ 2.12
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
CNNM4-201ENST00000377075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CNNM4-201ENST00000377075 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.16■■■□□ 2.1
CNNM4-201ENST00000377075 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CNNM4-201ENST00000377075 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CNNM4-201ENST00000377075 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CNNM4-201ENST00000377075 CLIP1P30622 1438 aa28.1■■■□□ 2.09
CNNM4-201ENST00000377075 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.1■■■□□ 2.09
CNNM4-201ENST00000377075 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CNNM4-201ENST00000377075 BCL11AQ9H165 835 aa28.02■■■□□ 2.08
CNNM4-201ENST00000377075 CEP162Q5TB80 1403 aa28.02■■■□□ 2.08
CNNM4-201ENST00000377075 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.99■■■□□ 2.07
CNNM4-201ENST00000377075 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CNNM4-201ENST00000377075 MRS2Q9HD23 443 aa27.88■■■□□ 2.05
CNNM4-201ENST00000377075 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CNNM4-201ENST00000377075 TMC1Q8TDI8 760 aa27.83■■■□□ 2.05
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.83■■■□□ 2.04
CNNM4-201ENST00000377075 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.8■■■□□ 2.04
CNNM4-201ENST00000377075 GOLGA3Q08378 1498 aa27.8■■■□□ 2.04
CNNM4-201ENST00000377075 EEA1Q15075 1411 aa27.77■■■□□ 2.04
CNNM4-201ENST00000377075 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.75■■■□□ 2.03
CNNM4-201ENST00000377075 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.74■■■□□ 2.03
CNNM4-201ENST00000377075 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.73■■■□□ 2.03
CNNM4-201ENST00000377075 NBR1Q14596 966 aa27.72■■■□□ 2.03
CNNM4-201ENST00000377075 NEFMP07197 916 aa27.7■■■□□ 2.02
CNNM4-201ENST00000377075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
CNNM4-201ENST00000377075 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
CNNM4-201ENST00000377075 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
CNNM4-201ENST00000377075 SLC24A1O60721 1099 aa27.66■■■□□ 2.02
CNNM4-201ENST00000377075 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CNNM4-201ENST00000377075 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.61■■■□□ 2.01
CNNM4-201ENST00000377075 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.59■■■□□ 2.01
CNNM4-201ENST00000377075 TSPY4P0CV99 314 aa27.57■■■□□ 2
CNNM4-201ENST00000377075 TSPY10P0CW01 314 aa27.57■■■□□ 2
CNNM4-201ENST00000377075 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.53■■■□□ 2
CNNM4-201ENST00000377075 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
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