Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA6P23229 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms