RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409991.5

NLRX1-204, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 3,716 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-204ENST00000409991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.57■■■□□ 2.48
NLRX1-204ENST00000409991 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.51■■□□□ 1.99
NLRX1-204ENST00000409991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.91■■□□□ 1.9
NLRX1-204ENST00000409991 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NLRX1-204ENST00000409991 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.71■■□□□ 1.71
NLRX1-204ENST00000409991 ABCC9O60706 1549 aa25.71■■□□□ 1.71
NLRX1-204ENST00000409991 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NLRX1-204ENST00000409991 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
NLRX1-204ENST00000409991 SCRIBQ14160 1630 aa24.86■■□□□ 1.57
NLRX1-204ENST00000409991 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.75■■□□□ 1.55
NLRX1-204ENST00000409991 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.56■■□□□ 1.52
NLRX1-204ENST00000409991 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
NLRX1-204ENST00000409991 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.5■■□□□ 1.51
NLRX1-204ENST00000409991 NACADO15069 1562 aa24.34■■□□□ 1.49
NLRX1-204ENST00000409991 TRIM41Q8WV44 630 aa24.3■■□□□ 1.48
NLRX1-204ENST00000409991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.27■■□□□ 1.48
NLRX1-204ENST00000409991 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.2■■□□□ 1.46
NLRX1-204ENST00000409991 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.17■■□□□ 1.46
NLRX1-204ENST00000409991 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NLRX1-204ENST00000409991 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.02■■□□□ 1.44
NLRX1-204ENST00000409991 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.87■■□□□ 1.41
NLRX1-204ENST00000409991 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
NLRX1-204ENST00000409991 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
NLRX1-204ENST00000409991 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.67■■□□□ 1.38
NLRX1-204ENST00000409991 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NLRX1-204ENST00000409991 WIZO95785 1651 aa23.62■■□□□ 1.37
NLRX1-204ENST00000409991 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NLRX1-204ENST00000409991 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NLRX1-204ENST00000409991 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.31■■□□□ 1.32
NLRX1-204ENST00000409991 SMARCA4P51532 1647 aa23.3■■□□□ 1.32
NLRX1-204ENST00000409991 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.28■■□□□ 1.32
NLRX1-204ENST00000409991 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
NLRX1-204ENST00000409991 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.24■■□□□ 1.31
NLRX1-204ENST00000409991 ABCC8Q09428 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
NLRX1-204ENST00000409991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.14■■□□□ 1.29
NLRX1-204ENST00000409991 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
NLRX1-204ENST00000409991 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.08■■□□□ 1.28
NLRX1-204ENST00000409991 APLP2Q06481 763 aa22.96■■□□□ 1.27
NLRX1-204ENST00000409991 SOGA1O94964 1423 aa22.95■■□□□ 1.27
NLRX1-204ENST00000409991 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.27
NLRX1-204ENST00000409991 SMARCA2P51531 1590 aa22.95■■□□□ 1.26
NLRX1-204ENST00000409991 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NLRX1-204ENST00000409991 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NLRX1-204ENST00000409991 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NLRX1-204ENST00000409991 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.83■■□□□ 1.25
NLRX1-204ENST00000409991 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.78■■□□□ 1.24
NLRX1-204ENST00000409991 P3H3Q8IVL6 736 aa22.67■■□□□ 1.22
NLRX1-204ENST00000409991 NCAPD3P42695 1498 aa22.67■■□□□ 1.22
NLRX1-204ENST00000409991 HRCP23327 699 aa22.62■■□□□ 1.21
NLRX1-204ENST00000409991 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NLRX1-204ENST00000409991 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NLRX1-204ENST00000409991 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NLRX1-204ENST00000409991 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.55■■□□□ 1.2
NLRX1-204ENST00000409991 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.54■■□□□ 1.2
NLRX1-204ENST00000409991 ITGAEP38570 1179 aa22.54■■□□□ 1.2
NLRX1-204ENST00000409991 CEP162Q5TB80 1403 aa22.52■■□□□ 1.2
NLRX1-204ENST00000409991 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.46■■□□□ 1.19
NLRX1-204ENST00000409991 FBLN2P98095 1184 aa22.45■■□□□ 1.18
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NLRX1-204ENST00000409991 GOLGA3Q08378 1498 aa22.41■■□□□ 1.18
NLRX1-204ENST00000409991 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.39■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 ARID3CA6NKF2 412 aa22.39■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 CLIP1P30622 1438 aa22.38■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 CUX2O14529 1486 aa22.38■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 KIF27Q86VH2 1401 aa22.37■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 HMGXB3Q12766 1538 aa22.35■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 CFTRP13569 1480 aa22.33■■□□□ 1.17
NLRX1-204ENST00000409991 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.32■■□□□ 1.16
NLRX1-204ENST00000409991 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.32■■□□□ 1.16
NLRX1-204ENST00000409991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.31■■□□□ 1.16
NLRX1-204ENST00000409991 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NLRX1-204ENST00000409991 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.2■■□□□ 1.14
NLRX1-204ENST00000409991 CUX1P39880 1505 aa22.2■■□□□ 1.14
NLRX1-204ENST00000409991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.2■■□□□ 1.14
NLRX1-204ENST00000409991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
NLRX1-204ENST00000409991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.15■■□□□ 1.14
NLRX1-204ENST00000409991 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NLRX1-204ENST00000409991 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NLRX1-204ENST00000409991 ERCC6Q03468 1493 aa22.11■■□□□ 1.13
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NLRX1-204ENST00000409991 TOP2BQ02880 1626 aa22.06■■□□□ 1.12
NLRX1-204ENST00000409991 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NLRX1-204ENST00000409991 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NLRX1-204ENST00000409991 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.93■■□□□ 1.1
NLRX1-204ENST00000409991 TOPBP1Q92547 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
NLRX1-204ENST00000409991 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NLRX1-204ENST00000409991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
NLRX1-204ENST00000409991 PRXQ9BXM0 1461 aa21.85■■□□□ 1.09
NLRX1-204ENST00000409991 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.81■■□□□ 1.08
NLRX1-204ENST00000409991 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NLRX1-204ENST00000409991 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.77■■□□□ 1.08
NLRX1-204ENST00000409991 KIF21BO75037 1637 aa21.77■■□□□ 1.08
NLRX1-204ENST00000409991 ARAP1Q96P48 1450 aa21.74■■□□□ 1.07
NLRX1-204ENST00000409991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.74■■□□□ 1.07
NLRX1-204ENST00000409991 NEUROD1Q13562 356 aa21.72■■□□□ 1.07
NLRX1-204ENST00000409991 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.71■■□□□ 1.07
NLRX1-204ENST00000409991 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.71■■□□□ 1.07
NLRX1-204ENST00000409991 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.71■■□□□ 1.07
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