Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ITGA6P23229 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ITGA6P23229 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ITGA6P23229 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ITGA6P23229 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ITGA6P23229 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ITGA6P23229 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
ITGA6P23229 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITGA6P23229 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ITGA6P23229 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ITGA6P23229 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ITGA6P23229 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ITGA6P23229 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITGA6P23229 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ITGA6P23229 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
ITGA6P23229 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ITGA6P23229 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITGA6P23229 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ITGA6P23229 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ITGA6P23229 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ITGA6P23229 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITGA6P23229 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ITGA6P23229 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ITGA6P23229 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITGA6P23229 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ITGA6P23229 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ITGA6P23229 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ITGA6P23229 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ITGA6P23229 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ITGA6P23229 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ITGA6P23229 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ITGA6P23229 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ITGA6P23229 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ITGA6P23229 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ITGA6P23229 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ITGA6P23229 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITGA6P23229 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITGA6P23229 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ITGA6P23229 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ITGA6P23229 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ITGA6P23229 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGA6P23229 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ITGA6P23229 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ITGA6P23229 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGA6P23229 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ITGA6P23229 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGA6P23229 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ITGA6P23229 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ITGA6P23229 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ITGA6P23229 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ITGA6P23229 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ITGA6P23229 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ITGA6P23229 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ITGA6P23229 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ITGA6P23229 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITGA6P23229 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITGA6P23229 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ITGA6P23229 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ITGA6P23229 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ITGA6P23229 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITGA6P23229 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITGA6P23229 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGA6P23229 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ITGA6P23229 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
ITGA6P23229 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ITGA6P23229 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ITGA6P23229 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGA6P23229 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ITGA6P23229 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ITGA6P23229 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ITGA6P23229 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGA6P23229 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGA6P23229 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGA6P23229 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ITGA6P23229 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ITGA6P23229 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ITGA6P23229 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ITGA6P23229 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ITGA6P23229 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGA6P23229 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGA6P23229 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGA6P23229 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGA6P23229 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGA6P23229 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ITGA6P23229 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ITGA6P23229 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ITGA6P23229 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ITGA6P23229 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ITGA6P23229 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ITGA6P23229 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ITGA6P23229 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGA6P23229 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ITGA6P23229 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ITGA6P23229 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGA6P23229 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
ITGA6P23229 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGA6P23229 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGA6P23229 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ITGA6P23229 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ITGA6P23229 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms