RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511166.1

CCDC169-SOHLH2-201, Transcript of CCDC169-SOHLH2 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC169-SOHLH2, Length 2,051 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.32■■■■□ 3.08
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.88■■■□□ 2.21
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 NACADO15069 1562 aa28.81■■■□□ 2.2
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.34■■■□□ 2.13
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.03■■■□□ 2.08
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 SMARCA2P51531 1590 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.48■■□□□ 1.83
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.39■■□□□ 1.82
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 NESP48681 1621 aa26.11■■□□□ 1.77
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.85■■□□□ 1.73
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.79■■□□□ 1.72
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.72■■□□□ 1.71
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.55■■□□□ 1.68
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.54■■□□□ 1.68
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.53■■□□□ 1.68
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 WDR62O43379 1518 aa25.45■■□□□ 1.66
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 PRDM2Q13029 1718 aa25.33■■□□□ 1.65
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 TOPBP1Q92547 1522 aa25.11■■□□□ 1.61
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ABCC8Q09428 1581 aa25.05■■□□□ 1.6
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CUX1P39880 1505 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.81■■□□□ 1.56
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 OSCARQ8IYS5 282 aa24.78■■□□□ 1.56
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
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CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 TOP2BQ02880 1626 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CHD1O14646 1710 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 GRIN2BQ13224 1484 aa24.51■■□□□ 1.51
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.51■■□□□ 1.51
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 TRIM41Q8WV44 630 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.43■■□□□ 1.5
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 PBRM1Q86U86 1689 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 SYNJ2O15056 1496 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ARHGEF11O15085 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ADAMTS12P58397 1594 aa24.22■■□□□ 1.47
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.21■■□□□ 1.47
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.2■■□□□ 1.47
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 GRIN2AQ12879 1464 aa24.2■■□□□ 1.46
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.19■■□□□ 1.46
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ARAP1Q96P48 1450 aa24.15■■□□□ 1.46
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 NUP160Q12769 1436 aa24.1■■□□□ 1.45
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 KIF27Q86VH2 1401 aa24.09■■□□□ 1.45
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CEP170Q5SW79 1584 aa24.09■■□□□ 1.45
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 IGF1RP08069 1367 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.95■■□□□ 1.42
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CUL7Q14999 1698 aa23.92■■□□□ 1.42
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 SHROOM2Q13796 1616 aa23.91■■□□□ 1.42
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.9■■□□□ 1.42
CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 JPH4Q96JJ6 628 aa23.89■■□□□ 1.41
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