Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms