RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.94■■■■■ 4.46
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC9O60706 1549 aa39.93■■■■□ 3.98
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.11■■■■□ 3.85
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.35■■■■□ 3.73
SPCS1-201ENST00000233025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.62■■■■□ 3.61
SPCS1-201ENST00000233025 NACADO15069 1562 aa37.12■■■■□ 3.53
SPCS1-201ENST00000233025 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.96■■■■□ 3.51
SPCS1-201ENST00000233025 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.91■■■■□ 3.5
SPCS1-201ENST00000233025 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.65■■■■□ 3.46
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.4■■■■□ 3.42
SPCS1-201ENST00000233025 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.29■■■■□ 3.4
SPCS1-201ENST00000233025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.11■■■■□ 3.37
SPCS1-201ENST00000233025 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.09■■■■□ 3.37
SPCS1-201ENST00000233025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.01■■■■□ 3.36
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.94■■■■□ 3.34
SPCS1-201ENST00000233025 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
SPCS1-201ENST00000233025 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
SPCS1-201ENST00000233025 SCRIBQ14160 1630 aa35.47■■■■□ 3.27
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.45■■■■□ 3.27
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SPCS1-201ENST00000233025 CUX2O14529 1486 aa34.89■■■■□ 3.18
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC6Q03468 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
SPCS1-201ENST00000233025 NCAPD3P42695 1498 aa34.24■■■■□ 3.07
SPCS1-201ENST00000233025 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.09■■■■□ 3.05
SPCS1-201ENST00000233025 NESP48681 1621 aa34.05■■■■□ 3.04
SPCS1-201ENST00000233025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SPCS1-201ENST00000233025 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34■■■■□ 3.03
SPCS1-201ENST00000233025 HMGXB3Q12766 1538 aa33.97■■■■□ 3.03
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCA2P51531 1590 aa33.86■■■■□ 3.01
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM41Q8WV44 630 aa33.85■■■■□ 3.01
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCA4P51532 1647 aa33.78■■■■□ 3
SPCS1-201ENST00000233025 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.7■■■□□ 2.99
SPCS1-201ENST00000233025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.68■■■□□ 2.98
SPCS1-201ENST00000233025 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
SPCS1-201ENST00000233025 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.48■■■□□ 2.95
SPCS1-201ENST00000233025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.42■■■□□ 2.94
SPCS1-201ENST00000233025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
SPCS1-201ENST00000233025 WDR62O43379 1518 aa33.28■■■□□ 2.92
SPCS1-201ENST00000233025 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.25■■■□□ 2.91
SPCS1-201ENST00000233025 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.09■■■□□ 2.89
SPCS1-201ENST00000233025 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.08■■■□□ 2.89
SPCS1-201ENST00000233025 OSCARQ8IYS5 282 aa32.96■■■□□ 2.87
SPCS1-201ENST00000233025 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.9■■■□□ 2.86
SPCS1-201ENST00000233025 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.86■■■□□ 2.85
SPCS1-201ENST00000233025 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.86■■■□□ 2.85
SPCS1-201ENST00000233025 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.86■■■□□ 2.85
SPCS1-201ENST00000233025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.76■■■□□ 2.84
SPCS1-201ENST00000233025 WIZO95785 1651 aa32.67■■■□□ 2.82
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF11O15085 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
SPCS1-201ENST00000233025 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
SPCS1-201ENST00000233025 CFTRP13569 1480 aa32.56■■■□□ 2.8
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM2Q13029 1718 aa32.36■■■□□ 2.77
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
SPCS1-201ENST00000233025 IFT140Q96RY7 1462 aa32.28■■■□□ 2.76
SPCS1-201ENST00000233025 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.25■■■□□ 2.75
SPCS1-201ENST00000233025 ARAP1Q96P48 1450 aa32.23■■■□□ 2.75
SPCS1-201ENST00000233025 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
SPCS1-201ENST00000233025 CHD1O14646 1710 aa32.2■■■□□ 2.74
SPCS1-201ENST00000233025 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
SPCS1-201ENST00000233025 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
SPCS1-201ENST00000233025 TOPBP1Q92547 1522 aa32.06■■■□□ 2.72
SPCS1-201ENST00000233025 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
SPCS1-201ENST00000233025 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
SPCS1-201ENST00000233025 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.89■■■□□ 2.7
SPCS1-201ENST00000233025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.87■■■□□ 2.69
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC8Q09428 1581 aa31.86■■■□□ 2.69
SPCS1-201ENST00000233025 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.76■■■□□ 2.68
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.75■■■□□ 2.67
SPCS1-201ENST00000233025 FBLN2P98095 1184 aa31.73■■■□□ 2.67
SPCS1-201ENST00000233025 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
SPCS1-201ENST00000233025 SYNJ1O43426 1573 aa31.59■■■□□ 2.65
SPCS1-201ENST00000233025 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.56■■■□□ 2.64
SPCS1-201ENST00000233025 WDR97A6NE52 1622 aa31.53■■■□□ 2.64
SPCS1-201ENST00000233025 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.52■■■□□ 2.64
SPCS1-201ENST00000233025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
SPCS1-201ENST00000233025 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
SPCS1-201ENST00000233025 SOGA1O94964 1423 aa31.41■■■□□ 2.62
SPCS1-201ENST00000233025 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.4■■■□□ 2.62
SPCS1-201ENST00000233025 SYNJ2O15056 1496 aa31.35■■■□□ 2.61
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SPCS1-201ENST00000233025 GRIN2BQ13224 1484 aa31.31■■■□□ 2.6
SPCS1-201ENST00000233025 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.31■■■□□ 2.6
SPCS1-201ENST00000233025 PBRM1Q86U86 1689 aa31.26■■■□□ 2.6
SPCS1-201ENST00000233025 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.17■■■□□ 2.58
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.17■■■□□ 2.58
SPCS1-201ENST00000233025 CUX1P39880 1505 aa31.15■■■□□ 2.58
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.04■■■□□ 2.56
SPCS1-201ENST00000233025 CEP170Q5SW79 1584 aa31.01■■■□□ 2.56
SPCS1-201ENST00000233025 SHROOM2Q13796 1616 aa30.96■■■□□ 2.55
SPCS1-201ENST00000233025 GRIN2AQ12879 1464 aa30.94■■■□□ 2.54
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.91■■■□□ 2.54
SPCS1-201ENST00000233025 NUP160Q12769 1436 aa30.89■■■□□ 2.53
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS12P58397 1594 aa30.87■■■□□ 2.53
SPCS1-201ENST00000233025 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.72■■■□□ 2.51
SPCS1-201ENST00000233025 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.71■■■□□ 2.51
SPCS1-201ENST00000233025 DIP2BQ9P265 1576 aa30.69■■■□□ 2.5
SPCS1-201ENST00000233025 MAPKBP1O60336 1514 aa30.66■■■□□ 2.5
SPCS1-201ENST00000233025 KDM6BO15054 1643 aa30.65■■■□□ 2.5
SPCS1-201ENST00000233025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.61■■■□□ 2.49
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