RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381558.6

TNNT3-204, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT3, Length 1,258 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-204ENST00000381558 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.91■■■■□ 3.98
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TNNT3-204ENST00000381558 ABCC9O60706 1549 aa35.15■■■■□ 3.22
TNNT3-204ENST00000381558 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.75■■■□□ 2.99
TNNT3-204ENST00000381558 NACADO15069 1562 aa33.63■■■□□ 2.97
TNNT3-204ENST00000381558 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.42■■■□□ 2.94
TNNT3-204ENST00000381558 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.34■■■□□ 2.93
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TNNT3-204ENST00000381558 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.06■■■□□ 2.88
TNNT3-204ENST00000381558 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.92■■■□□ 2.86
TNNT3-204ENST00000381558 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.75■■■□□ 2.83
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TNNT3-204ENST00000381558 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.5■■■□□ 2.79
TNNT3-204ENST00000381558 SCRIBQ14160 1630 aa32.45■■■□□ 2.79
TNNT3-204ENST00000381558 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.42■■■□□ 2.78
TNNT3-204ENST00000381558 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
TNNT3-204ENST00000381558 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.81■■■□□ 2.68
TNNT3-204ENST00000381558 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
TNNT3-204ENST00000381558 SMARCA4P51532 1647 aa31.05■■■□□ 2.56
TNNT3-204ENST00000381558 NCAPD3P42695 1498 aa31.01■■■□□ 2.55
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TNNT3-204ENST00000381558 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.95■■■□□ 2.54
TNNT3-204ENST00000381558 SMARCA2P51531 1590 aa30.94■■■□□ 2.54
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TNNT3-204ENST00000381558 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.77■■■□□ 2.52
TNNT3-204ENST00000381558 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.71■■■□□ 2.51
TNNT3-204ENST00000381558 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
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TNNT3-204ENST00000381558 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
TNNT3-204ENST00000381558 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.27■■■□□ 2.44
TNNT3-204ENST00000381558 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
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TNNT3-204ENST00000381558 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.07■■■□□ 2.4
TNNT3-204ENST00000381558 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.98■■■□□ 2.39
TNNT3-204ENST00000381558 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TNNT3-204ENST00000381558 CFTRP13569 1480 aa29.82■■■□□ 2.36
TNNT3-204ENST00000381558 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.76■■■□□ 2.35
TNNT3-204ENST00000381558 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.74■■■□□ 2.35
TNNT3-204ENST00000381558 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.72■■■□□ 2.35
TNNT3-204ENST00000381558 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.68■■■□□ 2.34
TNNT3-204ENST00000381558 WDR62O43379 1518 aa29.67■■■□□ 2.34
TNNT3-204ENST00000381558 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.62■■■□□ 2.33
TNNT3-204ENST00000381558 PRDM2Q13029 1718 aa29.62■■■□□ 2.33
TNNT3-204ENST00000381558 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TNNT3-204ENST00000381558 ABCC8Q09428 1581 aa29.26■■■□□ 2.27
TNNT3-204ENST00000381558 TOPBP1Q92547 1522 aa29.2■■■□□ 2.27
TNNT3-204ENST00000381558 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TNNT3-204ENST00000381558 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.17■■■□□ 2.26
TNNT3-204ENST00000381558 IFT140Q96RY7 1462 aa29.14■■■□□ 2.26
TNNT3-204ENST00000381558 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TNNT3-204ENST00000381558 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
TNNT3-204ENST00000381558 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TNNT3-204ENST00000381558 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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TNNT3-204ENST00000381558 CUX1P39880 1505 aa28.84■■■□□ 2.21
TNNT3-204ENST00000381558 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
TNNT3-204ENST00000381558 SOGA1O94964 1423 aa28.81■■■□□ 2.2
TNNT3-204ENST00000381558 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.78■■■□□ 2.2
TNNT3-204ENST00000381558 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
TNNT3-204ENST00000381558 WDR97A6NE52 1622 aa28.76■■■□□ 2.19
TNNT3-204ENST00000381558 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TNNT3-204ENST00000381558 CHD1O14646 1710 aa28.58■■■□□ 2.17
TNNT3-204ENST00000381558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.55■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.55■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 TOP2BQ02880 1626 aa28.54■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 GRIN2BQ13224 1484 aa28.54■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.53■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.52■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TNNT3-204ENST00000381558 FBLN2P98095 1184 aa28.5■■■□□ 2.15
TNNT3-204ENST00000381558 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.48■■■□□ 2.15
TNNT3-204ENST00000381558 SYNJ1O43426 1573 aa28.48■■■□□ 2.15
TNNT3-204ENST00000381558 TRIM41Q8WV44 630 aa28.46■■■□□ 2.15
TNNT3-204ENST00000381558 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.46■■■□□ 2.15
TNNT3-204ENST00000381558 PBRM1Q86U86 1689 aa28.45■■■□□ 2.15
TNNT3-204ENST00000381558 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.42■■■□□ 2.14
TNNT3-204ENST00000381558 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.42■■■□□ 2.14
TNNT3-204ENST00000381558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.42■■■□□ 2.14
TNNT3-204ENST00000381558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TNNT3-204ENST00000381558 SYNJ2O15056 1496 aa28.4■■■□□ 2.14
TNNT3-204ENST00000381558 ARHGEF11O15085 1522 aa28.38■■■□□ 2.13
TNNT3-204ENST00000381558 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.28■■■□□ 2.12
TNNT3-204ENST00000381558 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.21■■■□□ 2.11
TNNT3-204ENST00000381558 ADAMTS12P58397 1594 aa28.2■■■□□ 2.11
TNNT3-204ENST00000381558 GRIN2AQ12879 1464 aa28.16■■■□□ 2.1
TNNT3-204ENST00000381558 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.16■■■□□ 2.1
TNNT3-204ENST00000381558 ARAP1Q96P48 1450 aa28.11■■■□□ 2.09
TNNT3-204ENST00000381558 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.1■■■□□ 2.09
TNNT3-204ENST00000381558 NUP160Q12769 1436 aa28.05■■■□□ 2.08
TNNT3-204ENST00000381558 CEP170Q5SW79 1584 aa28.01■■■□□ 2.07
TNNT3-204ENST00000381558 KIF27Q86VH2 1401 aa28.01■■■□□ 2.07
TNNT3-204ENST00000381558 CUL7Q14999 1698 aa27.91■■■□□ 2.06
TNNT3-204ENST00000381558 IGF1RP08069 1367 aa27.89■■■□□ 2.06
TNNT3-204ENST00000381558 SHROOM2Q13796 1616 aa27.89■■■□□ 2.05
TNNT3-204ENST00000381558 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.8■■■□□ 2.04
TNNT3-204ENST00000381558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.79■■■□□ 2.04
TNNT3-204ENST00000381558 JPH4Q96JJ6 628 aa27.74■■■□□ 2.03
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