RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.77■■■■□ 3.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.61■■■□□ 2.97
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCC9O60706 1549 aa32.45■■■□□ 2.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
MSC-AS1-208ENST00000522519 NACADO15069 1562 aa31.42■■■□□ 2.62
MSC-AS1-208ENST00000522519 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.41■■■□□ 2.62
MSC-AS1-208ENST00000522519 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.32■■■□□ 2.6
MSC-AS1-208ENST00000522519 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.29■■■□□ 2.6
MSC-AS1-208ENST00000522519 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.26■■■□□ 2.59
MSC-AS1-208ENST00000522519 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.92■■■□□ 2.54
MSC-AS1-208ENST00000522519 SCRIBQ14160 1630 aa30.61■■■□□ 2.49
MSC-AS1-208ENST00000522519 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.47■■■□□ 2.47
MSC-AS1-208ENST00000522519 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
MSC-AS1-208ENST00000522519 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.15■■■□□ 2.42
MSC-AS1-208ENST00000522519 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
MSC-AS1-208ENST00000522519 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.45■■■□□ 2.31
MSC-AS1-208ENST00000522519 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.45■■■□□ 2.31
MSC-AS1-208ENST00000522519 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.36■■■□□ 2.29
MSC-AS1-208ENST00000522519 SMARCA4P51532 1647 aa29.32■■■□□ 2.28
MSC-AS1-208ENST00000522519 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
MSC-AS1-208ENST00000522519 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.11■■■□□ 2.25
MSC-AS1-208ENST00000522519 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.03■■■□□ 2.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 SMARCA2P51531 1590 aa29.02■■■□□ 2.24
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29■■■□□ 2.23
MSC-AS1-208ENST00000522519 NCAPD3P42695 1498 aa28.93■■■□□ 2.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 HMGXB3Q12766 1538 aa28.9■■■□□ 2.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 WIZO95785 1651 aa28.89■■■□□ 2.22
MSC-AS1-208ENST00000522519 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
MSC-AS1-208ENST00000522519 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.21■■■□□ 2.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 NESP48681 1621 aa28.18■■■□□ 2.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.15■■■□□ 2.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRDM2Q13029 1718 aa28.1■■■□□ 2.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.06■■■□□ 2.08
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.01■■■□□ 2.08
MSC-AS1-208ENST00000522519 CFTRP13569 1480 aa28■■■□□ 2.07
MSC-AS1-208ENST00000522519 ERCC6Q03468 1493 aa27.94■■■□□ 2.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.9■■■□□ 2.06
MSC-AS1-208ENST00000522519 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
MSC-AS1-208ENST00000522519 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.79■■■□□ 2.04
MSC-AS1-208ENST00000522519 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.75■■■□□ 2.03
MSC-AS1-208ENST00000522519 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.65■■■□□ 2.02
MSC-AS1-208ENST00000522519 WDR62O43379 1518 aa27.6■■■□□ 2.01
MSC-AS1-208ENST00000522519 CUX2O14529 1486 aa27.59■■■□□ 2.01
MSC-AS1-208ENST00000522519 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
MSC-AS1-208ENST00000522519 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.44■■□□□ 1.98
MSC-AS1-208ENST00000522519 TOPBP1Q92547 1522 aa27.41■■□□□ 1.98
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCC8Q09428 1581 aa27.39■■□□□ 1.98
MSC-AS1-208ENST00000522519 CUX1P39880 1505 aa27.3■■□□□ 1.96
MSC-AS1-208ENST00000522519 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.24■■□□□ 1.95
MSC-AS1-208ENST00000522519 SYNJ1O43426 1573 aa27.19■■□□□ 1.94
MSC-AS1-208ENST00000522519 TOP2BQ02880 1626 aa27.18■■□□□ 1.94
MSC-AS1-208ENST00000522519 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
MSC-AS1-208ENST00000522519 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
MSC-AS1-208ENST00000522519 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.16■■□□□ 1.94
MSC-AS1-208ENST00000522519 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
MSC-AS1-208ENST00000522519 IFT140Q96RY7 1462 aa27.14■■□□□ 1.93
MSC-AS1-208ENST00000522519 WDR97A6NE52 1622 aa27.09■■□□□ 1.93
MSC-AS1-208ENST00000522519 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.03■■□□□ 1.92
MSC-AS1-208ENST00000522519 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
MSC-AS1-208ENST00000522519 SOGA1O94964 1423 aa27■■□□□ 1.91
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.91■■□□□ 1.9
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.87■■□□□ 1.89
MSC-AS1-208ENST00000522519 PBRM1Q86U86 1689 aa26.86■■□□□ 1.89
MSC-AS1-208ENST00000522519 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
MSC-AS1-208ENST00000522519 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
MSC-AS1-208ENST00000522519 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.74■■□□□ 1.87
MSC-AS1-208ENST00000522519 GRIN2BQ13224 1484 aa26.7■■□□□ 1.87
MSC-AS1-208ENST00000522519 CHD1O14646 1710 aa26.7■■□□□ 1.86
MSC-AS1-208ENST00000522519 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.65■■□□□ 1.86
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRIM41Q8WV44 630 aa26.62■■□□□ 1.85
MSC-AS1-208ENST00000522519 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.61■■□□□ 1.85
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADAMTS12P58397 1594 aa26.58■■□□□ 1.85
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF27Q86VH2 1401 aa26.57■■□□□ 1.84
MSC-AS1-208ENST00000522519 SYNJ2O15056 1496 aa26.51■■□□□ 1.83
MSC-AS1-208ENST00000522519 CUL7Q14999 1698 aa26.49■■□□□ 1.83
MSC-AS1-208ENST00000522519 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.49■■□□□ 1.83
MSC-AS1-208ENST00000522519 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.44■■□□□ 1.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.43■■□□□ 1.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 IGF1RP08069 1367 aa26.39■■□□□ 1.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 FBLN2P98095 1184 aa26.39■■□□□ 1.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 GRIN2AQ12879 1464 aa26.39■■□□□ 1.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 OSCARQ8IYS5 282 aa26.37■■□□□ 1.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.31■■□□□ 1.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.3■■□□□ 1.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 CEP170Q5SW79 1584 aa26.29■■□□□ 1.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 EEA1Q15075 1411 aa26.26■■□□□ 1.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.25■■□□□ 1.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 NUP160Q12769 1436 aa26.24■■□□□ 1.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.18■■□□□ 1.78
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRXQ9BXM0 1461 aa26.15■■□□□ 1.78
MSC-AS1-208ENST00000522519 SHROOM2Q13796 1616 aa26.13■■□□□ 1.77
MSC-AS1-208ENST00000522519 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.12■■□□□ 1.77
MSC-AS1-208ENST00000522519 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.11■■□□□ 1.77
MSC-AS1-208ENST00000522519 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.11■■□□□ 1.77
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