Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-FP30511 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-FP30511 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-FP30511 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms