RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523446.1

LINC01848-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1848, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01848, Length 518 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01848-201ENST00000523446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.1■■■■□ 3.21
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LINC01848-201ENST00000523446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.21■■■□□ 2.27
LINC01848-201ENST00000523446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.19■■■□□ 2.26
LINC01848-201ENST00000523446 NACADO15069 1562 aa29.18■■■□□ 2.26
LINC01848-201ENST00000523446 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.01■■■□□ 2.23
LINC01848-201ENST00000523446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29■■■□□ 2.23
LINC01848-201ENST00000523446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.75■■■□□ 2.19
LINC01848-201ENST00000523446 SCRIBQ14160 1630 aa28.54■■■□□ 2.16
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LINC01848-201ENST00000523446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.41■■□□□ 1.98
LINC01848-201ENST00000523446 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.32■■□□□ 1.96
LINC01848-201ENST00000523446 SMARCA4P51532 1647 aa27.27■■□□□ 1.96
LINC01848-201ENST00000523446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
LINC01848-201ENST00000523446 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.09■■□□□ 1.93
LINC01848-201ENST00000523446 SMARCA2P51531 1590 aa26.97■■□□□ 1.91
LINC01848-201ENST00000523446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.94■■□□□ 1.9
LINC01848-201ENST00000523446 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.92■■□□□ 1.9
LINC01848-201ENST00000523446 WIZO95785 1651 aa26.89■■□□□ 1.9
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LINC01848-201ENST00000523446 HMGXB3Q12766 1538 aa26.85■■□□□ 1.89
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LINC01848-201ENST00000523446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
LINC01848-201ENST00000523446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
LINC01848-201ENST00000523446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
LINC01848-201ENST00000523446 NESP48681 1621 aa26.25■■□□□ 1.79
LINC01848-201ENST00000523446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.21■■□□□ 1.79
LINC01848-201ENST00000523446 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.18■■□□□ 1.78
LINC01848-201ENST00000523446 PRDM2Q13029 1718 aa26.12■■□□□ 1.77
LINC01848-201ENST00000523446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.09■■□□□ 1.77
LINC01848-201ENST00000523446 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.07■■□□□ 1.76
LINC01848-201ENST00000523446 ERCC6Q03468 1493 aa26.05■■□□□ 1.76
LINC01848-201ENST00000523446 CFTRP13569 1480 aa26■■□□□ 1.75
LINC01848-201ENST00000523446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.94■■□□□ 1.74
LINC01848-201ENST00000523446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
LINC01848-201ENST00000523446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.86■■□□□ 1.73
LINC01848-201ENST00000523446 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.83■■□□□ 1.73
LINC01848-201ENST00000523446 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.73■■□□□ 1.71
LINC01848-201ENST00000523446 WDR62O43379 1518 aa25.66■■□□□ 1.7
LINC01848-201ENST00000523446 CUX2O14529 1486 aa25.64■■□□□ 1.69
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LINC01848-201ENST00000523446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.52■■□□□ 1.68
LINC01848-201ENST00000523446 TOPBP1Q92547 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
LINC01848-201ENST00000523446 ABCC8Q09428 1581 aa25.44■■□□□ 1.66
LINC01848-201ENST00000523446 CUX1P39880 1505 aa25.41■■□□□ 1.66
LINC01848-201ENST00000523446 SYNJ1O43426 1573 aa25.31■■□□□ 1.64
LINC01848-201ENST00000523446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.31■■□□□ 1.64
LINC01848-201ENST00000523446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
LINC01848-201ENST00000523446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
LINC01848-201ENST00000523446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.28■■□□□ 1.64
LINC01848-201ENST00000523446 TOP2BQ02880 1626 aa25.27■■□□□ 1.64
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LINC01848-201ENST00000523446 IFT140Q96RY7 1462 aa25.23■■□□□ 1.63
LINC01848-201ENST00000523446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC01848-201ENST00000523446 WDR97A6NE52 1622 aa25.18■■□□□ 1.62
LINC01848-201ENST00000523446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
LINC01848-201ENST00000523446 SOGA1O94964 1423 aa25.13■■□□□ 1.61
LINC01848-201ENST00000523446 PBRM1Q86U86 1689 aa25.01■■□□□ 1.59
LINC01848-201ENST00000523446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.01■■□□□ 1.59
LINC01848-201ENST00000523446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
LINC01848-201ENST00000523446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.98■■□□□ 1.59
LINC01848-201ENST00000523446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LINC01848-201ENST00000523446 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.88■■□□□ 1.57
LINC01848-201ENST00000523446 CHD1O14646 1710 aa24.86■■□□□ 1.57
LINC01848-201ENST00000523446 GRIN2BQ13224 1484 aa24.83■■□□□ 1.57
LINC01848-201ENST00000523446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.83■■□□□ 1.56
LINC01848-201ENST00000523446 TRIM41Q8WV44 630 aa24.8■■□□□ 1.56
LINC01848-201ENST00000523446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
LINC01848-201ENST00000523446 ADAMTS12P58397 1594 aa24.73■■□□□ 1.55
LINC01848-201ENST00000523446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.72■■□□□ 1.55
LINC01848-201ENST00000523446 KIF27Q86VH2 1401 aa24.71■■□□□ 1.55
LINC01848-201ENST00000523446 SYNJ2O15056 1496 aa24.65■■□□□ 1.54
LINC01848-201ENST00000523446 FBLN2P98095 1184 aa24.64■■□□□ 1.54
LINC01848-201ENST00000523446 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.64■■□□□ 1.54
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LINC01848-201ENST00000523446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LINC01848-201ENST00000523446 GRIN2AQ12879 1464 aa24.54■■□□□ 1.52
LINC01848-201ENST00000523446 OSCARQ8IYS5 282 aa24.53■■□□□ 1.52
LINC01848-201ENST00000523446 IGF1RP08069 1367 aa24.53■■□□□ 1.52
LINC01848-201ENST00000523446 CEP170Q5SW79 1584 aa24.48■■□□□ 1.51
LINC01848-201ENST00000523446 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
LINC01848-201ENST00000523446 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC01848-201ENST00000523446 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC01848-201ENST00000523446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC01848-201ENST00000523446 NUP160Q12769 1436 aa24.38■■□□□ 1.49
LINC01848-201ENST00000523446 EEA1Q15075 1411 aa24.38■■□□□ 1.49
LINC01848-201ENST00000523446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
LINC01848-201ENST00000523446 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.34■■□□□ 1.49
LINC01848-201ENST00000523446 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.32■■□□□ 1.48
LINC01848-201ENST00000523446 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.32■■□□□ 1.48
LINC01848-201ENST00000523446 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.32■■□□□ 1.48
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