RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528419.5

CTSW-204, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CTSW, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-204ENST00000528419 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.25■■■■□ 3.23
CTSW-204ENST00000528419 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.29■■■□□ 2.6
CTSW-204ENST00000528419 ABCC9O60706 1549 aa30.44■■■□□ 2.46
CTSW-204ENST00000528419 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CTSW-204ENST00000528419 NACADO15069 1562 aa29.38■■■□□ 2.29
CTSW-204ENST00000528419 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.37■■■□□ 2.29
CTSW-204ENST00000528419 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.28■■■□□ 2.28
CTSW-204ENST00000528419 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.28■■■□□ 2.28
CTSW-204ENST00000528419 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.21■■■□□ 2.27
CTSW-204ENST00000528419 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.68■■■□□ 2.18
CTSW-204ENST00000528419 SCRIBQ14160 1630 aa28.52■■■□□ 2.16
CTSW-204ENST00000528419 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.49■■■□□ 2.15
CTSW-204ENST00000528419 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
CTSW-204ENST00000528419 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
CTSW-204ENST00000528419 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.82■■■□□ 2.04
CTSW-204ENST00000528419 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CTSW-204ENST00000528419 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.55■■■□□ 2
CTSW-204ENST00000528419 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.43■■□□□ 1.98
CTSW-204ENST00000528419 SMARCA4P51532 1647 aa27.32■■□□□ 1.96
CTSW-204ENST00000528419 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTSW-204ENST00000528419 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.16■■□□□ 1.94
CTSW-204ENST00000528419 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.14■■□□□ 1.94
CTSW-204ENST00000528419 NCAPD3P42695 1498 aa27.12■■□□□ 1.93
CTSW-204ENST00000528419 SMARCA2P51531 1590 aa27.11■■□□□ 1.93
CTSW-204ENST00000528419 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.09■■□□□ 1.93
CTSW-204ENST00000528419 HMGXB3Q12766 1538 aa27.01■■□□□ 1.91
CTSW-204ENST00000528419 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTSW-204ENST00000528419 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CTSW-204ENST00000528419 WIZO95785 1651 aa26.86■■□□□ 1.89
CTSW-204ENST00000528419 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CTSW-204ENST00000528419 NESP48681 1621 aa26.4■■□□□ 1.82
CTSW-204ENST00000528419 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.37■■□□□ 1.81
CTSW-204ENST00000528419 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.31■■□□□ 1.8
CTSW-204ENST00000528419 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.28■■□□□ 1.8
CTSW-204ENST00000528419 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CTSW-204ENST00000528419 ERCC6Q03468 1493 aa26.22■■□□□ 1.79
CTSW-204ENST00000528419 CFTRP13569 1480 aa26.2■■□□□ 1.78
CTSW-204ENST00000528419 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.17■■□□□ 1.78
CTSW-204ENST00000528419 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.08■■□□□ 1.77
CTSW-204ENST00000528419 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.01■■□□□ 1.75
CTSW-204ENST00000528419 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CTSW-204ENST00000528419 PRDM2Q13029 1718 aa25.99■■□□□ 1.75
CTSW-204ENST00000528419 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.96■■□□□ 1.75
CTSW-204ENST00000528419 CUX2O14529 1486 aa25.93■■□□□ 1.74
CTSW-204ENST00000528419 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.9■■□□□ 1.74
CTSW-204ENST00000528419 WDR62O43379 1518 aa25.83■■□□□ 1.73
CTSW-204ENST00000528419 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CTSW-204ENST00000528419 ABCC8Q09428 1581 aa25.62■■□□□ 1.69
CTSW-204ENST00000528419 TOPBP1Q92547 1522 aa25.62■■□□□ 1.69
CTSW-204ENST00000528419 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.6■■□□□ 1.69
CTSW-204ENST00000528419 CUX1P39880 1505 aa25.48■■□□□ 1.67
CTSW-204ENST00000528419 IFT140Q96RY7 1462 aa25.42■■□□□ 1.66
CTSW-204ENST00000528419 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTSW-204ENST00000528419 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.36■■□□□ 1.65
CTSW-204ENST00000528419 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
CTSW-204ENST00000528419 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTSW-204ENST00000528419 TOP2BQ02880 1626 aa25.3■■□□□ 1.64
CTSW-204ENST00000528419 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.3■■□□□ 1.64
CTSW-204ENST00000528419 SYNJ1O43426 1573 aa25.29■■□□□ 1.64
CTSW-204ENST00000528419 SOGA1O94964 1423 aa25.29■■□□□ 1.64
CTSW-204ENST00000528419 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTSW-204ENST00000528419 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.28■■□□□ 1.64
CTSW-204ENST00000528419 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTSW-204ENST00000528419 WDR97A6NE52 1622 aa25.16■■□□□ 1.62
CTSW-204ENST00000528419 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
CTSW-204ENST00000528419 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.14■■□□□ 1.62
CTSW-204ENST00000528419 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTSW-204ENST00000528419 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.03■■□□□ 1.6
CTSW-204ENST00000528419 GAPVD1Q14C86 1478 aa25■■□□□ 1.59
CTSW-204ENST00000528419 GRIN2BQ13224 1484 aa24.99■■□□□ 1.59
CTSW-204ENST00000528419 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.94■■□□□ 1.58
CTSW-204ENST00000528419 PBRM1Q86U86 1689 aa24.94■■□□□ 1.58
CTSW-204ENST00000528419 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.93■■□□□ 1.58
CTSW-204ENST00000528419 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTSW-204ENST00000528419 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.84■■□□□ 1.57
CTSW-204ENST00000528419 CHD1O14646 1710 aa24.83■■□□□ 1.57
CTSW-204ENST00000528419 OSCARQ8IYS5 282 aa24.83■■□□□ 1.56
CTSW-204ENST00000528419 SYNJ2O15056 1496 aa24.82■■□□□ 1.56
CTSW-204ENST00000528419 TRIM41Q8WV44 630 aa24.81■■□□□ 1.56
CTSW-204ENST00000528419 KIF27Q86VH2 1401 aa24.8■■□□□ 1.56
CTSW-204ENST00000528419 ADAMTS12P58397 1594 aa24.78■■□□□ 1.56
CTSW-204ENST00000528419 FBLN2P98095 1184 aa24.77■■□□□ 1.56
CTSW-204ENST00000528419 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTSW-204ENST00000528419 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.73■■□□□ 1.55
CTSW-204ENST00000528419 IGF1RP08069 1367 aa24.7■■□□□ 1.54
CTSW-204ENST00000528419 GRIN2AQ12879 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
CTSW-204ENST00000528419 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.63■■□□□ 1.53
CTSW-204ENST00000528419 CUL7Q14999 1698 aa24.63■■□□□ 1.53
CTSW-204ENST00000528419 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.62■■□□□ 1.53
CTSW-204ENST00000528419 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.61■■□□□ 1.53
CTSW-204ENST00000528419 NUP160Q12769 1436 aa24.57■■□□□ 1.52
CTSW-204ENST00000528419 CEP170Q5SW79 1584 aa24.55■■□□□ 1.52
CTSW-204ENST00000528419 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.54■■□□□ 1.52
CTSW-204ENST00000528419 ARHGEF11O15085 1522 aa24.47■■□□□ 1.51
CTSW-204ENST00000528419 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
CTSW-204ENST00000528419 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
CTSW-204ENST00000528419 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
CTSW-204ENST00000528419 EEA1Q15075 1411 aa24.43■■□□□ 1.5
CTSW-204ENST00000528419 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.42■■□□□ 1.5
CTSW-204ENST00000528419 PRXQ9BXM0 1461 aa24.4■■□□□ 1.5
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