Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-8■□□□□ 9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-216ENST00000541416 996 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.292e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.32e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-207ENST00000537965 578 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.612e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.642e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.672e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 24.59□□□□□ -1.672e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.5□□□□□ -1.692e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 54.39□□□□□ -1.712e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 24.01□□□□□ -1.772e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 23.93□□□□□ -1.782e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.832e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.282e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.247e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 519.92■□□□□ 0.783e-7■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.091e-323■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.266e-7■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.816e-7■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 PCED1A-204ENST00000448755 1170 ntTSL 319.62■□□□□ 0.736e-7■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 PCED1A-203ENST00000439542 1187 ntTSL 216.78■□□□□ 0.286e-7■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 314.83□□□□□ -0.043e-18■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.62e-26■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.872e-67■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 SNHG7-202ENST00000416970 789 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.692e-67■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.432e-67■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.52e-67■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.52e-67■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 422.66■■□□□ 1.221e-15■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 EPHA2-202ENST00000461614 875 ntTSL 226.27■■□□□ 1.82e-7■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 UTRN-206ENST00000421035 572 ntTSL 27.95□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 UTRN-213ENST00000628146 597 ntTSL 24.44□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 8.7
UTP18Q9Y5J1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.862e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.244e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.752e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 213.7□□□□□ -0.223e-10■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.434e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 410.91□□□□□ -0.663e-10■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 210.58□□□□□ -0.723e-10■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.794e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.982e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.982e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 38.71□□□□□ -1.022e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.192e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 57.26□□□□□ -1.254e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.762e-16■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.962e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.92e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.812e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.742e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 522.24■■□□□ 1.152e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 PTMA-207ENST00000440384 222 ntTSL 320.39■□□□□ 0.854e-7■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 519.77■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 8.6
UTP18Q9Y5J1 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 224.63■■□□□ 1.531e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 323.6■■□□□ 1.371e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 221.88■■□□□ 1.091e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FANCA-223ENST00000567284 479 ntTSL 310.18□□□□□ -0.781e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FANCA-224ENST00000567510 461 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.665e-11■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.258e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.698e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.678e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 CLASRP-205ENST00000585432 290 ntTSL 219.02■□□□□ 0.648e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 MTSS1L-202ENST00000562883 407 ntTSL 218.97■□□□□ 0.638e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 MTSS1L-203ENST00000576338 518 ntTSL 318.97■□□□□ 0.638e-7■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)28.53■■■□□ 2.164e-6■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.94e-6■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.454e-6■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-6■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 215.18■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 8.5
UTP18Q9Y5J1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.099e-7■□□□□ 8.4
UTP18Q9Y5J1 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 225.57■■□□□ 1.689e-7■□□□□ 8.4
UTP18Q9Y5J1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.979e-7■□□□□ 8.4
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