Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 CASC19-267ENST00000641944 1117 nt6.55□□□□□ -1.367e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.45□□□□□ -1.387e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.42□□□□□ -1.387e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.34□□□□□ -1.397e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.47e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-234ENST00000641488 1157 nt6.22□□□□□ -1.417e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-237ENST00000641514 1074 nt6.22□□□□□ -1.417e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-256ENST00000641746 958 nt5.78□□□□□ -1.487e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.72□□□□□ -1.497e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.56□□□□□ -1.527e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.5□□□□□ -1.537e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.49□□□□□ -1.537e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.567e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-262ENST00000641867 866 nt5.16□□□□□ -1.587e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-215ENST00000641174 959 nt5.13□□□□□ -1.597e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-209ENST00000641060 679 nt4.58□□□□□ -1.687e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-231ENST00000641425 1156 nt4.5□□□□□ -1.697e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-217ENST00000641187 875 nt3.59□□□□□ -1.837e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.897e-9■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.678e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.298e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.258e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.158e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.148e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 SNX14-219ENST00000515216 3288 ntTSL 59.51□□□□□ -0.898e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-208ENST00000460627 4719 ntTSL 219.76■□□□□ 0.754e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.694e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-205ENST00000448472 3547 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.414e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-204ENST00000420973 3492 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.074e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 CHRD-212ENST00000470150 4234 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-7■■■□□ 15.9
HLTFQ14527 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.872e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZFP90-205ENST00000564558 4664 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZFP90-214ENST00000573113 505 ntTSL 26.94□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.528e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.528e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.877e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.67e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.917e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.37e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 33.37□□□□□ -1.877e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 TMEM45B-204ENST00000527754 888 ntTSL 57.74□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 TMEM45B-205ENST00000529381 515 ntTSL 26.33□□□□□ -1.41e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.13e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 DST-222ENST00000520645 4598 ntTSL 26.58□□□□□ -1.368e-7■■■□□ 15.8
HLTFQ14527 TTI1-205ENST00000487362 761 ntTSL 39.62□□□□□ -0.876e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 PVT1-204ENST00000517525 392 ntTSL 324.46■■□□□ 1.514e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.464e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.264e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC12.71□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.414e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-209ENST00000604238 1268 ntTSL 511.86□□□□□ -0.514e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-207ENST00000603011 774 ntTSL 510.37□□□□□ -0.754e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 MICU1-206ENST00000489666 579 ntTSL 48.25□□□□□ -1.094e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 ITFG2-205ENST00000537710 878 ntTSL 36.5□□□□□ -1.374e-7■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-213ENST00000450965 1918 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-215ENST00000480357 5668 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-209ENST00000437134 760 ntTSL 516.54■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-203ENST00000412508 585 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-208ENST00000433750 660 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.58□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-210ENST00000440143 415 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SCLY-220ENST00000497951 3800 ntTSL 29.95□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SMYD2-203ENST00000460580 1618 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SMYD2-204ENST00000471645 4732 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 SMYD2-206ENST00000491455 3809 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 HERC2P3-205ENST00000428453 4383 ntTSL 211.52□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 HERC2P3-209ENST00000437318 4161 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 15.7
HLTFQ14527 RNF213-218ENST00000574060 540 ntTSL 213.23□□□□□ -0.295e-7■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC12.12□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 LRMDA-210ENST00000593817 221 ntTSL 35.07□□□□□ -1.61e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-10■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-10■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 PRR5-213ENST00000492289 735 ntTSL 318.79■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.939e-7■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.789e-7■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.719e-7■■■□□ 15.6
HLTFQ14527 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.28e-7■■■□□ 15.6
Retrieved 100 of 6,978 protein–RNA pairs in 88.8 ms