Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms