RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603538.1

YTHDF3-AS1-201, Transcript of YTHDF3 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

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Gene YTHDF3-AS1, Length 718 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.38■■■■■ 4.06
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.42■■■■□ 3.42
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ABCC9O60706 1549 aa36.38■■■■□ 3.41
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.66■■■■□ 3.14
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NACADO15069 1562 aa34.38■■■■□ 3.09
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.14■■■■□ 3.06
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.91■■■■□ 3.02
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.9■■■■□ 3.02
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.87■■■■□ 3.01
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.73■■■□□ 2.99
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.66■■■□□ 2.98
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.42■■■□□ 2.94
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.28■■■□□ 2.92
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SCRIBQ14160 1630 aa33.09■■■□□ 2.89
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.92■■■□□ 2.86
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NCAPD3P42695 1498 aa31.7■■■□□ 2.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.59■■■□□ 2.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SMARCA4P51532 1647 aa31.58■■■□□ 2.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 HMGXB3Q12766 1538 aa31.54■■■□□ 2.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SMARCA2P51531 1590 aa31.54■■■□□ 2.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CUX2O14529 1486 aa31.49■■■□□ 2.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.47■■■□□ 2.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ERCC6Q03468 1493 aa31.43■■■□□ 2.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.31■■■□□ 2.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NESP48681 1621 aa31.22■■■□□ 2.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.1■■■□□ 2.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.06■■■□□ 2.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.9■■■□□ 2.54
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.81■■■□□ 2.52
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 WIZO95785 1651 aa30.73■■■□□ 2.51
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.68■■■□□ 2.5
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.61■■■□□ 2.49
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 WDR62O43379 1518 aa30.58■■■□□ 2.49
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.45■■■□□ 2.47
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.38■■■□□ 2.45
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CFTRP13569 1480 aa30.37■■■□□ 2.45
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PRDM2Q13029 1718 aa30.16■■■□□ 2.42
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TRIM41Q8WV44 630 aa29.98■■■□□ 2.39
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.95■■■□□ 2.39
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 OSCARQ8IYS5 282 aa29.85■■■□□ 2.37
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 IFT140Q96RY7 1462 aa29.84■■■□□ 2.37
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TOPBP1Q92547 1522 aa29.81■■■□□ 2.36
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.73■■■□□ 2.35
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ABCC8Q09428 1581 aa29.72■■■□□ 2.35
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ARHGEF11O15085 1522 aa29.53■■■□□ 2.32
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CHD1O14646 1710 aa29.48■■■□□ 2.31
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 WDR97A6NE52 1622 aa29.34■■■□□ 2.29
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.33■■■□□ 2.29
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.29■■■□□ 2.28
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SOGA1O94964 1423 aa29.27■■■□□ 2.28
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CUX1P39880 1505 aa29.25■■■□□ 2.27
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ARAP1Q96P48 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.22■■■□□ 2.27
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FBLN2P98095 1184 aa29.17■■■□□ 2.26
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.16■■■□□ 2.26
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.13■■■□□ 2.25
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GRIN2BQ13224 1484 aa29.1■■■□□ 2.25
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SYNJ1O43426 1573 aa29.1■■■□□ 2.25
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PBRM1Q86U86 1689 aa29.06■■■□□ 2.24
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SYNJ2O15056 1496 aa29.04■■■□□ 2.24
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29■■■□□ 2.23
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.97■■■□□ 2.23
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.97■■■□□ 2.23
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YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.81■■■□□ 2.2
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ADAMTS12P58397 1594 aa28.79■■■□□ 2.2
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TOP2BQ02880 1626 aa28.77■■■□□ 2.2
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GRIN2AQ12879 1464 aa28.75■■■□□ 2.19
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CEP170Q5SW79 1584 aa28.68■■■□□ 2.18
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NUP160Q12769 1436 aa28.67■■■□□ 2.18
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.63■■■□□ 2.17
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SHROOM2Q13796 1616 aa28.61■■■□□ 2.17
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.61■■■□□ 2.17
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.6■■■□□ 2.17
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.4■■■□□ 2.14
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.27■■■□□ 2.12
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 JPH4Q96JJ6 628 aa28.21■■■□□ 2.11
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