Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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TTLL9Q3SXZ7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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