Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APLFQ8IW19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms