Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LGALS9CQ6DKI2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LGALS9CQ6DKI2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LGALS9CQ6DKI2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LGALS9CQ6DKI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LGALS9CQ6DKI2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LGALS9CQ6DKI2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGALS9CQ6DKI2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LGALS9CQ6DKI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms