Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGALS9CQ6DKI2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGALS9CQ6DKI2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGALS9CQ6DKI2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGALS9CQ6DKI2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGALS9CQ6DKI2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGALS9CQ6DKI2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGALS9CQ6DKI2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGALS9CQ6DKI2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGALS9CQ6DKI2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGALS9CQ6DKI2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGALS9CQ6DKI2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGALS9CQ6DKI2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGALS9CQ6DKI2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGALS9CQ6DKI2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGALS9CQ6DKI2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGALS9CQ6DKI2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGALS9CQ6DKI2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGALS9CQ6DKI2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS9CQ6DKI2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS9CQ6DKI2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGALS9CQ6DKI2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGALS9CQ6DKI2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGALS9CQ6DKI2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGALS9CQ6DKI2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGALS9CQ6DKI2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGALS9CQ6DKI2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS9CQ6DKI2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGALS9CQ6DKI2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGALS9CQ6DKI2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGALS9CQ6DKI2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGALS9CQ6DKI2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGALS9CQ6DKI2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGALS9CQ6DKI2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGALS9CQ6DKI2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGALS9CQ6DKI2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGALS9CQ6DKI2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGALS9CQ6DKI2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGALS9CQ6DKI2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGALS9CQ6DKI2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGALS9CQ6DKI2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGALS9CQ6DKI2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGALS9CQ6DKI2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGALS9CQ6DKI2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGALS9CQ6DKI2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS9CQ6DKI2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS9CQ6DKI2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS9CQ6DKI2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS9CQ6DKI2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS9CQ6DKI2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS9CQ6DKI2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGALS9CQ6DKI2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGALS9CQ6DKI2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGALS9CQ6DKI2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGALS9CQ6DKI2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGALS9CQ6DKI2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGALS9CQ6DKI2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGALS9CQ6DKI2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGALS9CQ6DKI2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGALS9CQ6DKI2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGALS9CQ6DKI2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS9CQ6DKI2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGALS9CQ6DKI2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LGALS9CQ6DKI2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LGALS9CQ6DKI2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS9CQ6DKI2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGALS9CQ6DKI2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGALS9CQ6DKI2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGALS9CQ6DKI2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGALS9CQ6DKI2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGALS9CQ6DKI2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGALS9CQ6DKI2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGALS9CQ6DKI2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGALS9CQ6DKI2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGALS9CQ6DKI2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGALS9CQ6DKI2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LGALS9CQ6DKI2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGALS9CQ6DKI2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGALS9CQ6DKI2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGALS9CQ6DKI2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGALS9CQ6DKI2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS9CQ6DKI2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGALS9CQ6DKI2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGALS9CQ6DKI2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGALS9CQ6DKI2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LGALS9CQ6DKI2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LGALS9CQ6DKI2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGALS9CQ6DKI2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LGALS9CQ6DKI2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LGALS9CQ6DKI2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LGALS9CQ6DKI2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms