Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN34H7C241 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN34H7C241 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms