Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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