RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611299.4

SYTL3-205, Transcript of synaptotagmin like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SYTL3, Length 2,896 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3-205ENST00000611299 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.17■■■□□ 2.42
SYTL3-205ENST00000611299 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.33■■□□□ 1.81
SYTL3-205ENST00000611299 HRCP23327 699 aa26.09■■□□□ 1.77
SYTL3-205ENST00000611299 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SYTL3-205ENST00000611299 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SYTL3-205ENST00000611299 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SYTL3-205ENST00000611299 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.55■■□□□ 1.68
SYTL3-205ENST00000611299 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL3-205ENST00000611299 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.39■■□□□ 1.66
SYTL3-205ENST00000611299 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.38■■□□□ 1.65
SYTL3-205ENST00000611299 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SYTL3-205ENST00000611299 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.23■■□□□ 1.63
SYTL3-205ENST00000611299 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SYTL3-205ENST00000611299 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.78■■□□□ 1.56
SYTL3-205ENST00000611299 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.68■■□□□ 1.54
SYTL3-205ENST00000611299 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SYTL3-205ENST00000611299 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYTL3-205ENST00000611299 MYT1Q01538 1121 aa24.32■■□□□ 1.48
SYTL3-205ENST00000611299 ABCC9O60706 1549 aa24.3■■□□□ 1.48
SYTL3-205ENST00000611299 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SYTL3-205ENST00000611299 NEUROD1Q13562 356 aa24.11■■□□□ 1.45
SYTL3-205ENST00000611299 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SYTL3-205ENST00000611299 TRIM41Q8WV44 630 aa24.1■■□□□ 1.45
SYTL3-205ENST00000611299 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SYTL3-205ENST00000611299 SCRIBQ14160 1630 aa24.03■■□□□ 1.44
SYTL3-205ENST00000611299 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24■■□□□ 1.43
SYTL3-205ENST00000611299 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.98■■□□□ 1.43
SYTL3-205ENST00000611299 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.94■■□□□ 1.42
SYTL3-205ENST00000611299 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SYTL3-205ENST00000611299 NACADO15069 1562 aa23.65■■□□□ 1.38
SYTL3-205ENST00000611299 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SYTL3-205ENST00000611299 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.63■■□□□ 1.37
SYTL3-205ENST00000611299 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYTL3-205ENST00000611299 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.55■■□□□ 1.36
SYTL3-205ENST00000611299 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SYTL3-205ENST00000611299 WIZO95785 1651 aa23.46■■□□□ 1.35
SYTL3-205ENST00000611299 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SYTL3-205ENST00000611299 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SYTL3-205ENST00000611299 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SYTL3-205ENST00000611299 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SYTL3-205ENST00000611299 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.2■■□□□ 1.31
SYTL3-205ENST00000611299 ABCC8Q09428 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
SYTL3-205ENST00000611299 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL3-205ENST00000611299 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYTL3-205ENST00000611299 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
SYTL3-205ENST00000611299 CEP162Q5TB80 1403 aa23.06■■□□□ 1.28
SYTL3-205ENST00000611299 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
SYTL3-205ENST00000611299 MIER1Q8N108 512 aa23.05■■□□□ 1.28
SYTL3-205ENST00000611299 SOGA1O94964 1423 aa23.02■■□□□ 1.28
SYTL3-205ENST00000611299 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYTL3-205ENST00000611299 BCL11AQ9H165 835 aa22.95■■□□□ 1.27
SYTL3-205ENST00000611299 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.94■■□□□ 1.26
SYTL3-205ENST00000611299 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYTL3-205ENST00000611299 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.92■■□□□ 1.26
SYTL3-205ENST00000611299 SMARCA2P51531 1590 aa22.92■■□□□ 1.26
SYTL3-205ENST00000611299 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.91■■□□□ 1.26
SYTL3-205ENST00000611299 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.9■■□□□ 1.26
SYTL3-205ENST00000611299 SMARCA4P51532 1647 aa22.88■■□□□ 1.25
SYTL3-205ENST00000611299 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.83■■□□□ 1.25
SYTL3-205ENST00000611299 EEA1Q15075 1411 aa22.77■■□□□ 1.24
SYTL3-205ENST00000611299 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYTL3-205ENST00000611299 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SYTL3-205ENST00000611299 GOLGA3Q08378 1498 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL3-205ENST00000611299 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.73■■□□□ 1.23
SYTL3-205ENST00000611299 CLIP1P30622 1438 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL3-205ENST00000611299 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.54■■□□□ 1.2
SYTL3-205ENST00000611299 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SYTL3-205ENST00000611299 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.52■■□□□ 1.19
SYTL3-205ENST00000611299 SYNJ1O43426 1573 aa22.5■■□□□ 1.19
SYTL3-205ENST00000611299 KIF21BO75037 1637 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL3-205ENST00000611299 APLP2Q06481 763 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL3-205ENST00000611299 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL3-205ENST00000611299 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.4■■□□□ 1.18
SYTL3-205ENST00000611299 BCANQ96GW7 911 aa22.35■■□□□ 1.17
SYTL3-205ENST00000611299 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.32■■□□□ 1.16
SYTL3-205ENST00000611299 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYTL3-205ENST00000611299 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
SYTL3-205ENST00000611299 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SYTL3-205ENST00000611299 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYTL3-205ENST00000611299 KCNH8Q96L42 1107 aa22.17■■□□□ 1.14
SYTL3-205ENST00000611299 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SYTL3-205ENST00000611299 FKBP8Q14318 412 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL3-205ENST00000611299 TOP2BQ02880 1626 aa22.11■■□□□ 1.13
SYTL3-205ENST00000611299 ARAP1Q96P48 1450 aa22.1■■□□□ 1.13
SYTL3-205ENST00000611299 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SYTL3-205ENST00000611299 PRXQ9BXM0 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
SYTL3-205ENST00000611299 MSH5O43196 834 aa22.03■■□□□ 1.12
SYTL3-205ENST00000611299 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
SYTL3-205ENST00000611299 ITGAEP38570 1179 aa22.01■■□□□ 1.11
SYTL3-205ENST00000611299 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.99■■□□□ 1.11
SYTL3-205ENST00000611299 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYTL3-205ENST00000611299 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.92■■□□□ 1.1
SYTL3-205ENST00000611299 NCAPD3P42695 1498 aa21.9■■□□□ 1.1
SYTL3-205ENST00000611299 NEFLP07196 543 aa21.88■■□□□ 1.09
SYTL3-205ENST00000611299 CUX1P39880 1505 aa21.87■■□□□ 1.09
SYTL3-205ENST00000611299 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.87■■□□□ 1.09
SYTL3-205ENST00000611299 KIF27Q86VH2 1401 aa21.86■■□□□ 1.09
SYTL3-205ENST00000611299 CUX2O14529 1486 aa21.86■■□□□ 1.09
SYTL3-205ENST00000611299 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.85■■□□□ 1.09
SYTL3-205ENST00000611299 HMGXB3Q12766 1538 aa21.83■■□□□ 1.08
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