Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SMCO1Q147U7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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