RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531895.5

ANKRD42-208, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-208ENST00000531895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.32■■■■□ 3.08
ANKRD42-208ENST00000531895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.62■■■□□ 2.33
ANKRD42-208ENST00000531895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ANKRD42-208ENST00000531895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD42-208ENST00000531895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD42-208ENST00000531895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD42-208ENST00000531895 ABCC9O60706 1549 aa27.87■■■□□ 2.05
ANKRD42-208ENST00000531895 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD42-208ENST00000531895 NACADO15069 1562 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD42-208ENST00000531895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ANKRD42-208ENST00000531895 SCRIBQ14160 1630 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD42-208ENST00000531895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.19■■□□□ 1.94
ANKRD42-208ENST00000531895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
ANKRD42-208ENST00000531895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.82■■□□□ 1.88
ANKRD42-208ENST00000531895 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.78■■□□□ 1.88
ANKRD42-208ENST00000531895 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.62■■□□□ 1.85
ANKRD42-208ENST00000531895 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.54■■□□□ 1.84
ANKRD42-208ENST00000531895 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.52■■□□□ 1.84
ANKRD42-208ENST00000531895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
ANKRD42-208ENST00000531895 WIZO95785 1651 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD42-208ENST00000531895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ANKRD42-208ENST00000531895 SMARCA4P51532 1647 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD42-208ENST00000531895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ANKRD42-208ENST00000531895 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD42-208ENST00000531895 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD42-208ENST00000531895 SMARCA2P51531 1590 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD42-208ENST00000531895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
ANKRD42-208ENST00000531895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.79■■□□□ 1.72
ANKRD42-208ENST00000531895 TRIM41Q8WV44 630 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD42-208ENST00000531895 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD42-208ENST00000531895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
ANKRD42-208ENST00000531895 ABCC8Q09428 1581 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD42-208ENST00000531895 NCAPD3P42695 1498 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ANKRD42-208ENST00000531895 HMGXB3Q12766 1538 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD42-208ENST00000531895 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD42-208ENST00000531895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42-208ENST00000531895 SYNJ1O43426 1573 aa25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42-208ENST00000531895 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42-208ENST00000531895 SOGA1O94964 1423 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42-208ENST00000531895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD42-208ENST00000531895 CFTRP13569 1480 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD42-208ENST00000531895 TOP2BQ02880 1626 aa24.92■■□□□ 1.58
ANKRD42-208ENST00000531895 EEA1Q15075 1411 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD42-208ENST00000531895 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD42-208ENST00000531895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD42-208ENST00000531895 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD42-208ENST00000531895 PRDM2Q13029 1718 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD42-208ENST00000531895 CUX1P39880 1505 aa24.83■■□□□ 1.57
ANKRD42-208ENST00000531895 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD42-208ENST00000531895 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD42-208ENST00000531895 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.67■■□□□ 1.54
ANKRD42-208ENST00000531895 NESP48681 1621 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD42-208ENST00000531895 GOLGA3Q08378 1498 aa24.64■■□□□ 1.54
ANKRD42-208ENST00000531895 KIF21BO75037 1637 aa24.63■■□□□ 1.53
ANKRD42-208ENST00000531895 CEP162Q5TB80 1403 aa24.6■■□□□ 1.53
ANKRD42-208ENST00000531895 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD42-208ENST00000531895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD42-208ENST00000531895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ANKRD42-208ENST00000531895 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42-208ENST00000531895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD42-208ENST00000531895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD42-208ENST00000531895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42-208ENST00000531895 PRXQ9BXM0 1461 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD42-208ENST00000531895 KIF27Q86VH2 1401 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42-208ENST00000531895 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ANKRD42-208ENST00000531895 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.39■■□□□ 1.5
ANKRD42-208ENST00000531895 TOPBP1Q92547 1522 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD42-208ENST00000531895 CUX2O14529 1486 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD42-208ENST00000531895 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD42-208ENST00000531895 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 HRCP23327 699 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 IGF1RP08069 1367 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 CLIP1P30622 1438 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42-208ENST00000531895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42-208ENST00000531895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD42-208ENST00000531895 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD42-208ENST00000531895 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.14■■□□□ 1.46
ANKRD42-208ENST00000531895 WDR97A6NE52 1622 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42-208ENST00000531895 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42-208ENST00000531895 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42-208ENST00000531895 ARAP1Q96P48 1450 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD42-208ENST00000531895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42-208ENST00000531895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42-208ENST00000531895 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD42-208ENST00000531895 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ANKRD42-208ENST00000531895 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD42-208ENST00000531895 CUL7Q14999 1698 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD42-208ENST00000531895 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.92■■□□□ 1.42
ANKRD42-208ENST00000531895 WDR62O43379 1518 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD42-208ENST00000531895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.4
ANKRD42-208ENST00000531895 APLP2Q06481 763 aa23.79■■□□□ 1.4
ANKRD42-208ENST00000531895 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ANKRD42-208ENST00000531895 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.77■■□□□ 1.4
ANKRD42-208ENST00000531895 PBRM1Q86U86 1689 aa23.76■■□□□ 1.39
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ANKRD42-208ENST00000531895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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