Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SMCO1Q147U7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO1Q147U7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMCO1Q147U7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMCO1Q147U7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMCO1Q147U7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMCO1Q147U7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMCO1Q147U7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMCO1Q147U7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMCO1Q147U7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMCO1Q147U7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMCO1Q147U7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMCO1Q147U7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMCO1Q147U7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMCO1Q147U7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMCO1Q147U7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMCO1Q147U7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMCO1Q147U7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMCO1Q147U7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMCO1Q147U7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMCO1Q147U7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMCO1Q147U7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMCO1Q147U7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMCO1Q147U7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMCO1Q147U7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMCO1Q147U7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMCO1Q147U7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMCO1Q147U7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMCO1Q147U7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMCO1Q147U7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMCO1Q147U7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMCO1Q147U7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMCO1Q147U7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMCO1Q147U7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMCO1Q147U7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMCO1Q147U7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMCO1Q147U7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMCO1Q147U7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMCO1Q147U7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMCO1Q147U7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMCO1Q147U7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMCO1Q147U7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMCO1Q147U7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMCO1Q147U7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMCO1Q147U7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMCO1Q147U7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMCO1Q147U7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMCO1Q147U7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMCO1Q147U7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMCO1Q147U7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMCO1Q147U7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMCO1Q147U7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMCO1Q147U7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMCO1Q147U7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMCO1Q147U7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMCO1Q147U7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMCO1Q147U7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMCO1Q147U7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMCO1Q147U7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMCO1Q147U7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMCO1Q147U7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMCO1Q147U7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMCO1Q147U7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMCO1Q147U7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMCO1Q147U7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMCO1Q147U7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMCO1Q147U7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMCO1Q147U7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMCO1Q147U7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMCO1Q147U7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMCO1Q147U7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMCO1Q147U7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMCO1Q147U7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMCO1Q147U7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMCO1Q147U7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMCO1Q147U7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMCO1Q147U7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMCO1Q147U7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMCO1Q147U7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMCO1Q147U7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMCO1Q147U7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMCO1Q147U7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMCO1Q147U7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMCO1Q147U7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMCO1Q147U7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMCO1Q147U7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMCO1Q147U7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMCO1Q147U7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMCO1Q147U7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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