Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SDCCAG3Q96C92 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SDCCAG3Q96C92 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SDCCAG3Q96C92 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SDCCAG3Q96C92 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SDCCAG3Q96C92 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SDCCAG3Q96C92 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SDCCAG3Q96C92 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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