RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635218.1

LINC00466-208, long intergenic non-protein coding RNA 466, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00466, Length 1,217 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00466-208ENST00000635218 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.11■■■■■ 4.01
LINC00466-208ENST00000635218 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.65■■■■□ 3.3
LINC00466-208ENST00000635218 ABCC9O60706 1549 aa34.91■■■■□ 3.18
LINC00466-208ENST00000635218 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.55■■■□□ 2.96
LINC00466-208ENST00000635218 NACADO15069 1562 aa33.54■■■□□ 2.96
LINC00466-208ENST00000635218 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.42■■■□□ 2.94
LINC00466-208ENST00000635218 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
LINC00466-208ENST00000635218 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.38■■■□□ 2.93
LINC00466-208ENST00000635218 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.21■■■□□ 2.91
LINC00466-208ENST00000635218 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.83■■■□□ 2.85
LINC00466-208ENST00000635218 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.62■■■□□ 2.81
LINC00466-208ENST00000635218 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.62■■■□□ 2.81
LINC00466-208ENST00000635218 SCRIBQ14160 1630 aa32.48■■■□□ 2.79
LINC00466-208ENST00000635218 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
LINC00466-208ENST00000635218 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.19■■■□□ 2.74
LINC00466-208ENST00000635218 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
LINC00466-208ENST00000635218 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.59■■■□□ 2.65
LINC00466-208ENST00000635218 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.38■■■□□ 2.61
LINC00466-208ENST00000635218 SMARCA4P51532 1647 aa31.11■■■□□ 2.57
LINC00466-208ENST00000635218 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
LINC00466-208ENST00000635218 NCAPD3P42695 1498 aa30.99■■■□□ 2.55
LINC00466-208ENST00000635218 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.98■■■□□ 2.55
LINC00466-208ENST00000635218 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.92■■■□□ 2.54
LINC00466-208ENST00000635218 SMARCA2P51531 1590 aa30.89■■■□□ 2.54
LINC00466-208ENST00000635218 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.85■■■□□ 2.53
LINC00466-208ENST00000635218 HMGXB3Q12766 1538 aa30.79■■■□□ 2.52
LINC00466-208ENST00000635218 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
LINC00466-208ENST00000635218 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LINC00466-208ENST00000635218 WIZO95785 1651 aa30.55■■■□□ 2.48
LINC00466-208ENST00000635218 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
LINC00466-208ENST00000635218 NESP48681 1621 aa30.22■■■□□ 2.43
LINC00466-208ENST00000635218 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.12■■■□□ 2.41
LINC00466-208ENST00000635218 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.05■■■□□ 2.4
LINC00466-208ENST00000635218 ERCC6Q03468 1493 aa30.03■■■□□ 2.4
LINC00466-208ENST00000635218 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.9■■■□□ 2.38
LINC00466-208ENST00000635218 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.89■■■□□ 2.38
LINC00466-208ENST00000635218 CFTRP13569 1480 aa29.88■■■□□ 2.37
LINC00466-208ENST00000635218 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.84■■■□□ 2.37
LINC00466-208ENST00000635218 CUX2O14529 1486 aa29.8■■■□□ 2.36
LINC00466-208ENST00000635218 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
LINC00466-208ENST00000635218 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.68■■■□□ 2.34
LINC00466-208ENST00000635218 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
LINC00466-208ENST00000635218 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.63■■■□□ 2.33
LINC00466-208ENST00000635218 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.61■■■□□ 2.33
LINC00466-208ENST00000635218 PRDM2Q13029 1718 aa29.59■■■□□ 2.33
LINC00466-208ENST00000635218 WDR62O43379 1518 aa29.55■■■□□ 2.32
LINC00466-208ENST00000635218 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
LINC00466-208ENST00000635218 TOPBP1Q92547 1522 aa29.22■■■□□ 2.27
LINC00466-208ENST00000635218 ABCC8Q09428 1581 aa29.19■■■□□ 2.26
LINC00466-208ENST00000635218 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.17■■■□□ 2.26
LINC00466-208ENST00000635218 IFT140Q96RY7 1462 aa29.03■■■□□ 2.24
LINC00466-208ENST00000635218 CUX1P39880 1505 aa28.99■■■□□ 2.23
LINC00466-208ENST00000635218 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.98■■■□□ 2.23
LINC00466-208ENST00000635218 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LINC00466-208ENST00000635218 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LINC00466-208ENST00000635218 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LINC00466-208ENST00000635218 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.88■■■□□ 2.21
LINC00466-208ENST00000635218 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.85■■■□□ 2.21
LINC00466-208ENST00000635218 SOGA1O94964 1423 aa28.84■■■□□ 2.21
LINC00466-208ENST00000635218 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
LINC00466-208ENST00000635218 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
LINC00466-208ENST00000635218 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
LINC00466-208ENST00000635218 TOP2BQ02880 1626 aa28.72■■■□□ 2.19
LINC00466-208ENST00000635218 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.72■■■□□ 2.19
LINC00466-208ENST00000635218 SYNJ1O43426 1573 aa28.71■■■□□ 2.19
LINC00466-208ENST00000635218 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
LINC00466-208ENST00000635218 WDR97A6NE52 1622 aa28.66■■■□□ 2.18
LINC00466-208ENST00000635218 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.62■■■□□ 2.17
LINC00466-208ENST00000635218 OSCARQ8IYS5 282 aa28.55■■■□□ 2.16
LINC00466-208ENST00000635218 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.51■■■□□ 2.15
LINC00466-208ENST00000635218 GRIN2BQ13224 1484 aa28.5■■■□□ 2.15
LINC00466-208ENST00000635218 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.5■■■□□ 2.15
LINC00466-208ENST00000635218 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.46■■■□□ 2.15
LINC00466-208ENST00000635218 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
LINC00466-208ENST00000635218 PBRM1Q86U86 1689 aa28.42■■■□□ 2.14
LINC00466-208ENST00000635218 CHD1O14646 1710 aa28.41■■■□□ 2.14
LINC00466-208ENST00000635218 FBLN2P98095 1184 aa28.33■■■□□ 2.13
LINC00466-208ENST00000635218 SYNJ2O15056 1496 aa28.32■■■□□ 2.12
LINC00466-208ENST00000635218 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
LINC00466-208ENST00000635218 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.26■■■□□ 2.11
LINC00466-208ENST00000635218 ADAMTS12P58397 1594 aa28.21■■■□□ 2.11
LINC00466-208ENST00000635218 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.18■■■□□ 2.1
LINC00466-208ENST00000635218 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.16■■■□□ 2.1
LINC00466-208ENST00000635218 KIF27Q86VH2 1401 aa28.16■■■□□ 2.1
LINC00466-208ENST00000635218 GRIN2AQ12879 1464 aa28.15■■■□□ 2.1
LINC00466-208ENST00000635218 IGF1RP08069 1367 aa28.11■■■□□ 2.09
LINC00466-208ENST00000635218 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
LINC00466-208ENST00000635218 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
LINC00466-208ENST00000635218 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
LINC00466-208ENST00000635218 ARHGEF11O15085 1522 aa28.09■■■□□ 2.09
LINC00466-208ENST00000635218 NUP160Q12769 1436 aa28.05■■■□□ 2.08
LINC00466-208ENST00000635218 CEP170Q5SW79 1584 aa28.02■■■□□ 2.08
LINC00466-208ENST00000635218 TRIM41Q8WV44 630 aa28.01■■■□□ 2.07
LINC00466-208ENST00000635218 CUL7Q14999 1698 aa27.96■■■□□ 2.07
LINC00466-208ENST00000635218 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.95■■■□□ 2.06
LINC00466-208ENST00000635218 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.9■■■□□ 2.06
LINC00466-208ENST00000635218 ARAP1Q96P48 1450 aa27.89■■■□□ 2.05
LINC00466-208ENST00000635218 SHROOM2Q13796 1616 aa27.85■■■□□ 2.05
LINC00466-208ENST00000635218 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.82■■■□□ 2.04
LINC00466-208ENST00000635218 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms