RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517635.2

HOXA-AS2-202, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXA-AS2, Length 2,455 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ABCC9O60706 1549 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SCRIBQ14160 1630 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA-AS2-202ENST00000517635 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NACADO15069 1562 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HRCP23327 699 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXA-AS2-202ENST00000517635 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXA-AS2-202ENST00000517635 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA-AS2-202ENST00000517635 WIZO95785 1651 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
HOXA-AS2-202ENST00000517635 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TRIM41Q8WV44 630 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SMARCA4P51532 1647 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXA-AS2-202ENST00000517635 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS2-202ENST00000517635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SMARCA2P51531 1590 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA-AS2-202ENST00000517635 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ABCC8Q09428 1581 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-202ENST00000517635 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SOGA1O94964 1423 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-202ENST00000517635 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SYNJ1O43426 1573 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NCAPD3P42695 1498 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HMGXB3Q12766 1538 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CEP162Q5TB80 1403 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-202ENST00000517635 EEA1Q15075 1411 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-202ENST00000517635 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-202ENST00000517635 GOLGA3Q08378 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TOP2BQ02880 1626 aa23■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CFTRP13569 1480 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-202ENST00000517635 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CUX1P39880 1505 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-202ENST00000517635 KIF21BO75037 1637 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-202ENST00000517635 MYT1Q01538 1121 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CLIP1P30622 1438 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NEUROD1Q13562 356 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PRDM2Q13029 1718 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-202ENST00000517635 KIF27Q86VH2 1401 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PRXQ9BXM0 1461 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-202ENST00000517635 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CUX2O14529 1486 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NESP48681 1621 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-202ENST00000517635 APLP2Q06481 763 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-202ENST00000517635 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGF1RP08069 1367 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ARAP1Q96P48 1450 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TOPBP1Q92547 1522 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-202ENST00000517635 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-202ENST00000517635 MIER1Q8N108 512 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-202ENST00000517635 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-202ENST00000517635 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-202ENST00000517635 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-202ENST00000517635 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.27■■□□□ 1.16
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