Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SKP2Q13309 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms