RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.11■■■■□ 3.69
NSL1-201ENST00000366976 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.98■■■■□ 3.03
NSL1-201ENST00000366976 ABCC9O60706 1549 aa33.67■■■□□ 2.98
NSL1-201ENST00000366976 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
NSL1-201ENST00000366976 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.1■■■□□ 2.73
NSL1-201ENST00000366976 NACADO15069 1562 aa32.07■■■□□ 2.72
NSL1-201ENST00000366976 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.97■■■□□ 2.71
NSL1-201ENST00000366976 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.95■■■□□ 2.7
NSL1-201ENST00000366976 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.78■■■□□ 2.68
NSL1-201ENST00000366976 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
NSL1-201ENST00000366976 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.67■■■□□ 2.66
NSL1-201ENST00000366976 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.37■■■□□ 2.61
NSL1-201ENST00000366976 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.36■■■□□ 2.61
NSL1-201ENST00000366976 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
NSL1-201ENST00000366976 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.05■■■□□ 2.56
NSL1-201ENST00000366976 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.97■■■□□ 2.55
NSL1-201ENST00000366976 SCRIBQ14160 1630 aa30.79■■■□□ 2.52
NSL1-201ENST00000366976 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.46■■■□□ 2.47
NSL1-201ENST00000366976 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.35■■■□□ 2.45
NSL1-201ENST00000366976 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
NSL1-201ENST00000366976 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.65■■■□□ 2.34
NSL1-201ENST00000366976 NCAPD3P42695 1498 aa29.62■■■□□ 2.33
NSL1-201ENST00000366976 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
NSL1-201ENST00000366976 SMARCA4P51532 1647 aa29.55■■■□□ 2.32
NSL1-201ENST00000366976 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.51■■■□□ 2.31
NSL1-201ENST00000366976 SMARCA2P51531 1590 aa29.5■■■□□ 2.31
NSL1-201ENST00000366976 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.4■■■□□ 2.3
NSL1-201ENST00000366976 HMGXB3Q12766 1538 aa29.4■■■□□ 2.3
NSL1-201ENST00000366976 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.27■■■□□ 2.28
NSL1-201ENST00000366976 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
NSL1-201ENST00000366976 CUX2O14529 1486 aa29.19■■■□□ 2.26
NSL1-201ENST00000366976 ERCC6Q03468 1493 aa29.07■■■□□ 2.24
NSL1-201ENST00000366976 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NSL1-201ENST00000366976 WIZO95785 1651 aa28.88■■■□□ 2.21
NSL1-201ENST00000366976 NESP48681 1621 aa28.81■■■□□ 2.2
NSL1-201ENST00000366976 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.81■■■□□ 2.2
NSL1-201ENST00000366976 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.72■■■□□ 2.19
NSL1-201ENST00000366976 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
NSL1-201ENST00000366976 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
NSL1-201ENST00000366976 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.68■■■□□ 2.18
NSL1-201ENST00000366976 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.55■■■□□ 2.16
NSL1-201ENST00000366976 CFTRP13569 1480 aa28.49■■■□□ 2.15
NSL1-201ENST00000366976 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
NSL1-201ENST00000366976 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.3■■■□□ 2.12
NSL1-201ENST00000366976 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.29■■■□□ 2.12
NSL1-201ENST00000366976 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.28■■■□□ 2.12
NSL1-201ENST00000366976 WDR62O43379 1518 aa28.22■■■□□ 2.11
NSL1-201ENST00000366976 TRIM41Q8WV44 630 aa28.2■■■□□ 2.1
NSL1-201ENST00000366976 PRDM2Q13029 1718 aa28.11■■■□□ 2.09
NSL1-201ENST00000366976 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
NSL1-201ENST00000366976 ABCC8Q09428 1581 aa27.97■■■□□ 2.07
NSL1-201ENST00000366976 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
NSL1-201ENST00000366976 TOPBP1Q92547 1522 aa27.81■■■□□ 2.04
NSL1-201ENST00000366976 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.77■■■□□ 2.04
NSL1-201ENST00000366976 IFT140Q96RY7 1462 aa27.76■■■□□ 2.04
NSL1-201ENST00000366976 OSCARQ8IYS5 282 aa27.7■■■□□ 2.02
NSL1-201ENST00000366976 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
NSL1-201ENST00000366976 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.58■■■□□ 2.01
NSL1-201ENST00000366976 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.58■■■□□ 2.01
NSL1-201ENST00000366976 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.58■■■□□ 2.01
NSL1-201ENST00000366976 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NSL1-201ENST00000366976 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
NSL1-201ENST00000366976 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
NSL1-201ENST00000366976 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.51■■■□□ 2
NSL1-201ENST00000366976 SOGA1O94964 1423 aa27.49■■□□□ 1.99
NSL1-201ENST00000366976 CUX1P39880 1505 aa27.48■■□□□ 1.99
NSL1-201ENST00000366976 WDR97A6NE52 1622 aa27.45■■□□□ 1.98
NSL1-201ENST00000366976 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.43■■□□□ 1.98
NSL1-201ENST00000366976 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF11O15085 1522 aa27.37■■□□□ 1.97
NSL1-201ENST00000366976 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.971e-7■■■□□ 16.7
NSL1-201ENST00000366976 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.37■■□□□ 1.97
NSL1-201ENST00000366976 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
NSL1-201ENST00000366976 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
NSL1-201ENST00000366976 CHD1O14646 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
NSL1-201ENST00000366976 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.25■■□□□ 1.95
NSL1-201ENST00000366976 TOP2BQ02880 1626 aa27.24■■□□□ 1.95
NSL1-201ENST00000366976 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.21■■□□□ 1.95
NSL1-201ENST00000366976 GRIN2BQ13224 1484 aa27.2■■□□□ 1.95
NSL1-201ENST00000366976 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
NSL1-201ENST00000366976 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.15■■□□□ 1.94
NSL1-201ENST00000366976 SYNJ1O43426 1573 aa27.12■■□□□ 1.93
NSL1-201ENST00000366976 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.11■■□□□ 1.93
NSL1-201ENST00000366976 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.09■■□□□ 1.93
NSL1-201ENST00000366976 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.07■■□□□ 1.92
NSL1-201ENST00000366976 ARAP1Q96P48 1450 aa27.06■■□□□ 1.92
NSL1-201ENST00000366976 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NSL1-201ENST00000366976 SYNJ2O15056 1496 aa27.06■■□□□ 1.92
NSL1-201ENST00000366976 FBLN2P98095 1184 aa27.05■■□□□ 1.92
NSL1-201ENST00000366976 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
NSL1-201ENST00000366976 PBRM1Q86U86 1689 aa26.97■■□□□ 1.91
NSL1-201ENST00000366976 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.94■■□□□ 1.9
NSL1-201ENST00000366976 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.88■■□□□ 1.89
NSL1-201ENST00000366976 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.87■■□□□ 1.89
NSL1-201ENST00000366976 GRIN2AQ12879 1464 aa26.81■■□□□ 1.88
NSL1-201ENST00000366976 ADAMTS12P58397 1594 aa26.8■■□□□ 1.88
NSL1-201ENST00000366976 KIF27Q86VH2 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
NSL1-201ENST00000366976 NUP160Q12769 1436 aa26.76■■□□□ 1.87
NSL1-201ENST00000366976 IGF1RP08069 1367 aa26.71■■□□□ 1.87
NSL1-201ENST00000366976 CEP170Q5SW79 1584 aa26.61■■□□□ 1.85
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